基于16S rDNA分析湖北半夏内生菌群结构及代谢功能

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王帆帆

作者： 王帆帆;唐涛;郭杰;段媛媛;郭晓亮;游景茂

作者机构：

关键词： 半夏（Pinellia ternate）;内生细菌;多样性;菌群功能

期刊名称： 湖北农业科学

ISSN： 0439-8114

年卷期： 2021 年 023 期

页码： 172-176

收录情况： 北大核心

摘要： 为探究湖北半夏（Pinellia ternate）内生细菌的多样性、丰度及菌群功能,随机采集半夏植株样品,提取内生细菌基因组DNA,通过PCR扩增获得16S rDNA V3～V4片段。采用IlluminaMiSeq高通量测序技术分析半夏植株中的内生细菌菌群结构,共获得有效序列39 537条和用于物种分类的OTU数681条,包括6门、10纲、23目、29科、45属、26种的细菌。菌落多样性分析表明,湖北半夏内生细菌在门水平上,优势菌群为Proteobacteria,科水平上,Mitochondria和Pseudomonadaceae为优势菌群。功能预测结果表明,湖北半夏内生细菌编码的大多数基因与代谢相关,其次是基因信息处理、环境信息处理。

分类号： S567.239

  • 相关文献

[1]青藏高原矮火绒草内生细菌多样性及生物功能分析. 程亮. 2019

[2]不同品种苹果树内生细菌群落多样性及功能. 古丽尼沙·沙依木,张志东,杨波,章世奎,唐琦勇,宋素琴,朱静,郭春苗,顾美英. 2020

[3]新疆桃果内生细菌群落组成分析. 刘晓静,林杨,吕卓,石玲,李亚玲,李玲,何欢,朱璇,张志东. 2020

[4]桐花树内生和根际细菌多样性及抗血栓活性研究. 李菲,黄庶识,胡文进,李喆,黄媛林,王巧贞,潘信利. 2020

[5]广东和广西地区柑橘木虱内生细菌的分离鉴定及多样性分析. 宋晓兵,彭埃天,凌金锋,崔一平,程保平,陈霞. 2020

[6]库车小白杏内生细菌多样性及其产酶特性. 刘晓静,楚敏,朱静,顾美英,唐琦勇,孙建,朱璇,张志东. 2020

[7]基于宏基因组的茉莉花内生细菌多样性分析. 陈梅春,朱育菁,刘波,王阶平,刘晓港,杨文靖. 2018

[8]万顺铅锌矿区蜈蚣草内生细菌砷氧化基因(aox B)的多样性分析. 孙一好,陆巧灵,高雪,尼玛扎西,周敬明,王蓥燕,张小平,辜运富. 2019

[9]黑果枸杞不同组织内生细菌群落多样性. 顾美英,古丽尼沙·沙依木,张志东,朱静,刘晓静,唐琦勇,欧提库尔·玛合水提,宋素琴,冯雷,唐光木,徐万里. 2021

[10]基于高通量测序分析感染菌核病和健康桑果内生菌群落结构及多样性. 彭芳芳,魏召新,李勋兰,罗友进,韩国辉. 2021

[11]水稻种子内生细菌多样性及其分泌植物生长素能力的测定. 姜晓宇,高菊生,徐凤花,曹艳花,唐雪,张晓霞. 2013

[12]基于宏基因组的茉莉花内生细菌多样性分析. 陈梅春,朱育菁,刘波,王阶平,刘晓港,杨文靖. 2018

[13]柑橘黄龙病株不同部位内生细菌群落结构的多样性. 刘波,郑雪芳,孙大光,阮传清,范国成,段永平. 2011

[14]水稻4个生长时期茎部可培养内生菌多样性分析. 王雪君,贾瑞宗,郭运玲,徐林,左娇,孔华,郭安平. 2015

[15]小叶满江红内生细菌多样性的PCR-DGGE及电子显微镜分析. 郑斯平,陈彬,关雄,郑伟文. 2008

[16]不同栽培方式的铁皮石斛根、茎中内生细菌多样性及其抑菌活性研究. 王珊珊,刘佳萌,孙晶,贾宁,金诺,刘佳妮,范蓓,王凤忠. 2021

[17]暗褐网柄牛肝菌子实体内生细菌群落结构研究. 李彩红,侯娣,李燕,郭婷,纪光燕,罗顺珍,曹阳,纪开萍,鲍大鹏,于晓丹,杨瑞恒. 2024

[18]红地球葡萄健康叶片内生细菌多样性分析. 李燕,刘晓,龚林忠,孙其宝,王琦. 2017

[19]茄子植物内生细菌群落结构与多样性. 蓝江林,刘波,朱育菁,唐秋榕,林抗美,苏明星,史怀. 2009

[20]万顺铅锌矿区蜈蚣草内生细菌砷氧化基因(aoxB)的多样性分析. 孙一好,陆巧灵,高雪,尼玛扎西,周敬明,王蓥燕,张小平,辜运富. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序