北京黑猪FABP3和SCD基因多态性与肉品质性状关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 苏艳芳

作者： 苏艳芳;杨曼;牛乃琪;侯欣华;张龙超

作者机构：

关键词： 北京黑猪;FABP3;SCD;肉品质;关联分析

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2023 年 003 期

页码： 966-975

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在研究脂肪酸结合蛋白-3（fatty acid binding protein 3,FABP3）和硬脂酰基辅酶A脱氢酶（stearoyl-CoA desaturase,SCD）基因的多态性及其与肉品质性状的关联，从而能够在分子水平上指导北京黑猪的育种工作。本研究以413头北京黑猪为材料，收集肉品质性状数据并提取DNA和RNA,根据FABP3和SCD基因序列设计20对引物进行PCR扩增及测序，运用DNAStar软件分析测序结果，对FABP3和SCD基因进行不同基因型与北京黑猪肌内脂肪（intramuscular fat, IMF）含量的关联分析并运用荧光定量PCR对其进行基因表达差异分析。结果发现，FABP3基因存在1个错义突变（c.681A＞G）,SCD基因存在1个错义突变、2个同义突变以及2个3′UTR区突变。使用Duncan’s多重检验统计分析发现，SCD基因内的SNPs与肉品质性状关联均不显著；FABP3基因错义突变位点c.681A＞G与肉色L*和IMF含量显著关联（P＜0.05）。该错义突变导致FABP3蛋白第51位氨基酸残基由异亮氨酸（I）突变为苏氨酸（T）。利用qPCR开展FABP3 c.681A＞G两种纯合基因型（AA和GG）个体表达量差异分析，发现该突变位点两种纯合基因型个体间基因表达量差异不显著，说明FABP3 c.681A＞G错义突变位点可能通过影响蛋白功能来调控肌内脂肪含量和肉色L*性状。上述两个基因中只有1个位点与肉色L*和IMF含量关联显著，可以作为北京黑猪肉品质性状的候选基因功能位点，也能为北京黑猪肉品质育种提供了新的分子标记。

分类号： S828.2

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