江苏省及周边地区猪圆环病毒Ⅱ型(PCV2)分子流行病学调查

文献类型： 中文期刊

第一作者： 曹东阳

作者： 曹东阳;王小敏;钱爱东;何孔旺;茅爱华

作者机构：

关键词： 猪圆环病毒Ⅱ型;分子流行病学;遗传变异

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2016 年 32 卷 02 期

页码： 390-398

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解中国江苏省及周边地区猪圆环病毒Ⅱ型(PCV2)的分子流行病学以及毒株的遗传变异情况,本研究运用PCR技术对来源于不同地区、不同猪场且PCV2检测为阳性的样品进行全基因组序列的扩增和测序,共获得18株PCV2全基因序列,并对所得到的毒株进行遗传变异分析。结果表明,18株毒株与国内外的参考毒株同源性为93.5%~99.7%,而ORF2核苷酸及其推导的氨基酸序列同源性分别为87.1%~99.9%和84.2%~99.6%,说明毒株存在一定程度的变异。系统进化树分析结果显示18株毒株中有5株PCV2a,7株PCV2b,6株PCV2d,其中20150429YC全长为1 766 bp,与(HM038031.1 PCV2d等)参考毒株的同源性为100.0%,未发现PCV2c。同时,Cap蛋白的抗原表位和抗原性也发生了变化。说明,目前江苏省及周边地区猪群中PCV2感染较为普遍,PCV2的流行毒株以PCV2b基因型为主,PCV2d次之。

分类号： S855.3

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