小麦LBD基因家族的全基因组鉴定、表达特性及调控网络分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 邢光伟

作者： 邢光伟;王梦醒;马小飞;赵贤;张婷;聂小军;宋卫宁

作者机构：

关键词： 小麦;LBD基因家族;逆境胁迫;共表达网络;表达谱

期刊名称： 麦类作物学报

ISSN： 1009-1041

年卷期： 2017 年 07 期

页码： 855-863

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为深入发掘小麦LBD基因的功能,利用小麦最新基因组数据,通过生物信息学手段,对小麦LBD基因家族进行了鉴定,并对其表达特性及调控网络进行了分析。鉴定结果表明,本研究得到了75个小麦LBD基因,根据系统进化分析结果,可将它们划分为ClassⅠ和ClassⅡ两个亚家族。染色体定位结果表明,除了5D和7D外,其余染色体均含有LBD基因。共表达调控网络分析表明,15个LBD基因参与了小麦功能基因调控。利用RNA-seq数据对所有小麦LBD基因在不同组织以及不同逆境胁迫下的表达情况进行分析表明,小麦LBD基因在不同组织间和胁迫下存在着差异表达,多个组织特异和胁迫响应相关LBD基因被鉴定到,可作为后续功能研究的候选基因。

分类号： S512.1

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