基于转录组的芒果MYB家族基因的鉴定及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郑斌

作者： 郑斌;武红霞;王松标;马小卫;许文天;罗纯;姚全胜

作者机构：

关键词： 芒果;MYB家族基因;R2R3-MYB;生物信息学

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2017 年 07 期

页码： 1285-1294

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： MYB家族作为植物中较大的转录因子家族之一,参与调控植物的多种生理活动。本研究基于芒果果实转录组测序结果,鉴定出71个MYB家族蛋白,其中包含1个4R-MYB蛋白、3个R1R2R3-MYB蛋白、60个R2R3-MYB蛋白和7个MYB相关蛋白。进化树及基序分析表明:除个别蛋白外,相同类型的MYB蛋白均聚在一起,且相近分支的MYB蛋白具有相同或相似的基序。60个全长MYB家族蛋白中,大部分为不稳定蛋白,且均为不含跨膜结构和信号肽的亲水性蛋白,亚细胞定位分析均定位于细胞核。进化树分析发现芒果R2R3-MYB蛋白与拟南芥有较高的保守性。R2R3-MYB蛋白保守域分析发现,R2和R3结构域均有多个氨基酸保守不变。GO分析发现芒果R2R3-MYB蛋白共注释到生物学过程、细胞组分和分子功能3大类功能的15个亚类。

分类号： S667.7

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