甘薯褪绿斑病毒山东分离物全基因组扩增及遗传进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 韩志磊

作者： 韩志磊;李光艳;孙晓辉;吴斌;洪浩;庞宗洋;王树森;辛志梅;竺晓平;姜珊珊

作者机构：

关键词： 甘薯褪绿斑病毒;山东省;全基因组序列;外壳蛋白;遗传进化分析

期刊名称： 植物病理学报

ISSN： 0412-0914

年卷期： 2024 年 002 期

页码： 279-290

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解甘薯褪绿斑病毒（sweet potato chlorotic fleck virus, SPCFV）在山东省的发生及遗传进化情况，分别于2019年和2020年采集了131份甘薯样品，针对SPCFV进行病毒检测、全基因序列扩增、序列分析及遗传进化树构建。结果显示：SPCFV两年的检出率分别为7.1%和5.6%,所有SPCFV感染样品中皆为SPCFV与其他病毒的复合侵染。通过RACE和RT-PCR获得CFV-SD1和CFV-SD2两个全基因组序列，全长均为9 105 bp;与已报道分离物核苷酸序列一致性为72.9%～89.5%。全基因组遗传进化分析显示所有SPCFV分离物聚为两簇。且从不同样品中获得6个SPCFV山东分离物的外壳蛋白（coat protein, CP）序列，基于CP氨基酸序列开展遗传进化分析表明，山东分离物均归于亚洲类群的第一簇（Asian isolates 1）。氨基酸偏好性分析显示，CP氨基酸序列N端前35位同样存在多变区。本研究表明了山东省已成为SPCFV的常发区域，且病毒群体存在多样性，研究结果为指导SPCFV的有效防控提供了理论依据。

分类号： S435.311

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