青稞HvnJAZ4的生物信息学和表达模式分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王子傲
作者: 王子傲;田瑞;崔永梅;白羿雄;姚晓华;安立昆;吴昆仑
作者机构:
关键词: 青稞;HvnJAZ4蛋白;生物信息学分析;分子动力学模拟
期刊名称: 生物技术通报
ISSN: 1002-5464
年卷期: 2025 年 41 卷 001 期
页码: 173-185
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】茉莉酸(JA)信号途径抑制因子JAZs家族是植物JA信号调控途径中的重要组成部分,探索青稞JA信号抑制因子HvnJAZ4基因和蛋白结构、分子动力学以及表达模式特点,为青稞HvnJAZs基因家族调控机制研究提供参考。【方法】采用多种生物信息学方法对HvnJAZ4的基因和蛋白结构,以及分子动力学特点进行分析,并采用qPCR和亚细胞定位对其表达模式进行研究。【结果】HvnJAZ4启动子区域有与JA、脱落酸(ABA)、赤霉素(GA)、水杨酸(SA)、低温响应相关的顺式作用元件。HvnJAZ4由418个氨基酸组成,其中,α螺旋、延长链、β折叠、无规则卷曲所占比例分别为23.50%、12.47%、2.64%和61.39%,HvnJAZ4与野生二粒小麦TdJAZ4亲缘关系最近。HvnJAZ4具有典型的NT、ZIM和Jas结构域,ZIM结构域是HvnJAZ4与其他HvnJAZs以及HvnNINJA1发生互作的关键结构域,Jas结构域是HvnJAZ4与HvnCOI1b发生互作的关键结构域。分子动力学模拟发现HvnJAZ4·Jas短肽与JA-Ile互作的关键氨基酸位点1个,与HvnCOI1b互作的关键氨基酸位点8个。相对于叶、根、茎和茎节,HvnJAZ4在籽粒、分蘖芽中表达量较高,并受低温、MeJA、ABA、GA诱导表达,亚细胞定位结果表明,HvnJAZ4定位在细胞核上。【结论】青稞HvnJAZ4可能在JA调控青稞生长发育和逆境适应以及与其他激素协同调控中扮演着关键角色。
分类号: S512.3
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