平托花生叶绿体基因组特征及其系统发育分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张小利

作者： 张小利;刘波;范飞军;朱灵龙;宋度林;李付振

作者机构：

关键词： 平托花生;叶绿体基因组;SSR;系统发育分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2024 年 22 卷 022 期

页码： 7355-7365

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为明确平托花生叶绿体基因组结构特征及系统发育关系，本研究利用Illumina Hiseq测序平台获得了平托花生完整叶绿体基因组全长序列，对其进行基因注释和特征分析，并将该叶绿体基因组与其近缘物种构建最大似然(maximum likelihood, ML)系统进化树。结果表明：平托花生叶绿体基因组全长为156 185 bp，共注释出131个基因，其中unigenes有112种，包括80种蛋白编码基因、28种tRNA基因和4种rRNA基因；共鉴定到102个SSR位点，其中单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸和四核苷酸分别为60、29、4和9，未发现五核苷酸和六核苷酸重复基序；在平托花生叶绿体基因组中共检测到26 149个密码子，其中RSCU>1的密码子有29个且绝大多数以A或T结尾，亮氨酸密码子使用占比最高，为10.76%。基于18个物种构建的系统发育树显示，平托花生与其他花生属植物的亲缘关系相对较远，形成了单独的进化分支。本研究为平托花生种质资源鉴定、评价以及亲缘关系研究提供依据。

分类号： S565.2

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