东北马鹿肌肉生长抑制素基因序列的克隆、编码氨基酸序列及结构特征分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 巴恒星

作者: 巴恒星;邢秀梅;杨福合

作者机构:

关键词: 东北马鹿;肌肉生长抑制素基因;基因克隆;生物信息学

期刊名称: 黑龙江畜牧兽医

ISSN: 1004-7034

年卷期: 2009 年 09 期

页码: 1-4

收录情况: 北大核心

摘要: 以与东北马鹿物种最近的牛(Bos taurus cattle,序列号为AB076403)的肌肉生长抑制素(myo-statin,MSTN)基因序列为模版,根据该基因保守序列进行引物设计,扩增产物连接入pMD18-T载体,克隆出3个外显子片段。根据5′-GU-AG-3′规则和同源基因比对拼接出带有部分5′、3′末端的cDNA,并采用生物信息学技术对编码氨基酸序列进行蛋白质同源性比较和二级、三级结构等分析。结果表明:所获序列全长为1 128 bp,编码375个氨基酸;具有较明显的螺旋、片层和无规卷曲等二级结构;有1个较明显的跨膜区和1个疏水区,并发现明显的信号肽和糖基化位点。三级结构同源建模预测结果显示与Human Activin A的相似性为42%。结果说明东北马鹿和其他哺乳类生物的肌肉生长抑制素基因之间关系密切,并同属于TGF-β家族。

分类号: S829.9

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