海南普通野生稻不同居群rDNA ITS区序列的比较分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王晓玲

作者： 郭安平;彭于发;刘恩平;孔华;林海妹;贺立卡

作者机构：

关键词： 普通野生稻;核糖体DNA;ITS区;序列分析

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2008 年 29 卷 04 期

页码： 478-484

收录情况： CSTPCD

摘要： 以转bar基因粳稻(O. sativa ssp. japonica)YOO3为外类群,采用PAUP4.0等软件,对海南7个主要普通野生稻(O. rufipogon)核糖体基因(nrDNA)的内转录间隔区(ITS)全序列信息进行比较分析。结果表明,ITS全长为586～589 bp,其中ITS1为193～195 bp,共有20个变异位点数,G/C含量为72.02%～74.74%;ITS2为229～231 bp,共有12个变异位点数,G/C含量为75.55%～76.08%;离栽培稻越近的类群G/C含量越高。所有材料5.8S rDNA序列完全一致,全长164 bp,G/C占97 bp,含量为59.15%。各类群间ITS序列信息较丰富,且显示ITS1比ITS2进化速度要快。利用ITS差异信息序列进行聚类分析为鉴别不同居群的普通野生稻提供了分子依据。

分类号： S511.901

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