野猪CAPN10基因的生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李海涛
作者: 李海涛;杨秀芹;刘娣
作者机构:
关键词: 野猪;CAPN10;生物信息学
期刊名称: 东北农业大学学报
ISSN: 1005-9369
年卷期: 2012 年 43 卷 03 期
页码: 24-28
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了研究CAPN10基因的性质和功能,使用NCBI等网站提供的一系列在线工具和软件,对其基因序列及其编码蛋白的结构和特性进行生物信息学分析。结果表明,野猪CAPN10基因CDS全长2 004 bp,编码667个氨基酸,同源性比对发现CAPN10保守性较低,对选择编码氨基酸的密码子具有偏好性;进一步的蛋白特性分析表明,野猪CAPN10是一种等电点为8.24的不稳定水溶性蛋白,无信号肽序列和跨膜结构,具有磷酸化等功能化位点及钙蛋白酶类催化基序结构。
分类号: S865.9
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