鸡Smad4基因克隆、生物信息学及组织表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 黄正洋
作者: 黄正洋;王钱保;李春苗;黄华云;梁忠;穆春宇;黎寿丰;赵振华
作者机构:
关键词: 鸡;Smad4基因;克隆;表达分析
期刊名称: 中国畜牧兽医
ISSN: 1671-7236
年卷期: 2021 年 010 期
页码: 3522-3532
收录情况: 北大核心
摘要: 试验旨在克隆鸡Smad4基因,并对其进行生物信息学和组织表达分析。以苏禽3号优质黄羽肉鸡为试验对象,使用RACE技术扩增并克隆了鸡Smad4基因全长序列,对其进行生物信息学分析,构建系统进化树,并利用实时荧光定量PCR检测了Smad4基因在鸡各组织中的表达情况。结果显示,鸡Smad4基因全长序列包含17 bp的5′UTR、1 842 bp的开放阅读框和466 bp的3′UTR,有11个外显子和10个内含子,mRNA序列全长2 325 bp,可编码613个氨基酸。系统进化树显示,鸡Smad4与其他鸟类聚为一类。生物信息学分析显示,Smad4蛋白分子质量为65.43 ku,理论等电点为10.04,为亲水蛋白;含有2个保守结构域:MH1和MH2;二级结构由α-螺旋(18.11%)、延伸链(17.29%)和无规则卷曲(64.60%)组成。组织表达分析表明,Smad4基因在鸡的心脏、肝脏、空肠、卵巢中均有较高表达,而在胸肌中不表达。本试验成功获得了鸡Smad4基因全长序列,并初步研究了其组织表达规律,为进一步研究Smad4基因在鸡繁殖活动中的分子机制提供了理论依据。
分类号: S831.2
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