苹果茎沟病毒吉林沙果分离物全基因组序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李正男

作者： 李正男;张双纳;张尊平;范旭东;任芳;胡国君;董雅凤

作者机构：

关键词： 苹果;苹果茎沟病毒;基因组;系统发育;一致性;重组

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2018 年 04 期

页码： 641-649

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过RT-PCR结合RACE技术扩增到苹果茎沟病毒(Apple stem grooving virus,ASGV)吉林沙果分离物(ASGV-JLSG)全长基因组(登录号:FM616381),共含有6 496个核苷酸(nt),编码两个彼此重叠的开放阅读框(Open reading frame,ORF)。ORF1(37~6 354 nt)编码1个241 k D的多聚蛋白,含有甲基转移酶(Methyltransferase)、木瓜蛋白酶(Papain-like-protease)、解旋酶(Nucleotide triphosphate-binding helicase)、RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase)和C端的外壳蛋白(Coat protein,CP)等结构域。ORF2(4 788~5 750 nt)编码1个36 kD的运动蛋白(Movement protein,MP)。ASGV-JLSG分离物与Gen Bank公布的29个ASGV分离物全基因核苷酸序列一致性为79.20%~86.60%。系统发育分析结果表明,30个ASGV分离物分成2个组,分离物间没有表现出寄主专一性和地理分布规律。重组分析发现,ASGV-JLSG分离物是苹果茎沟病毒黄花梨分离物(ASGV-HH,JN701424)和柑橘碎叶病毒满头红分离物(CTLV-MTHK,C588948)的重组体。本研究中获得的ASGV-JLSG分离物基因组是来源于中国东北地区的首个ASGV基因组序列。

分类号： S436.619

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