菜心叶片响应高温胁迫的转录组分析及转录因子筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 庞强强

作者： 庞强强;孙晓东;周曼;蔡兴来;陈贻诵;王亚强

作者机构：

关键词： 菜心;高温胁迫;转录组;差异表达基因;转录因子

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2024 年 22 卷 008 期

页码： 2473-2487

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探索菜心响应高温胁迫的分子机制,挖掘高温胁迫相关基因.利用转录组测序技术,对热敏DH系CX7-3和耐热DH系CX1-7高温胁迫处理前后叶片中的转录情况进行分析,建立差异表达基因库,并从中筛选高温胁迫转录因子.结果表明,转录组测序共获得32.25 Gb的样本数据和46 204条unigene,在9个功能数据库中有76.76%的unigene得到注释.比较高温胁迫前后样本,获得3 803个差异表达基因.GO功能分类可将DEG富集到生物过程、细胞组分和分子功能3个方面,KEGG功能富集数量居于前三位的为植物-病原相互作用、植物激素信号转导和植物MAPK信号通路.从差异表达基因库中鉴定得到275个转录因子,主要涉及MYB、AP2、C3H、NAC、C2H2、bHLH、bZIP、HSF和WRKY等34类转录因子家族,且受高温诱导呈现多种表达模式.进一步筛选获得15个共表达、4个特有表达、1个非特有表达转录因子基因.挑选12个转录因子基因进行RT-qPCR验证,基因表达趋势与RNA-seq分析结果一致.本研究结果为今后开展菜心耐热分子机制和耐热新品种的选育提供理论参考.

分类号： S634.5

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