口蹄疫病毒株AF/72结构蛋白VP1克隆及其T细胞表位预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘新生

作者： 刘新生;王永录

作者机构：

关键词： 口蹄疫病毒;T细胞表位;VP1蛋白

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2010 年 25 卷 05 期

页码： 31-35

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以AF/72RNA为模板,反转录并扩增目的cDNA,然后与pGEM-T easy体连接并转化JM109菌株,提取的重组质粒用凝胶电泳、PCR和EcoRI酶切法鉴定。应用BIMAS生物学软件对AF/72株结构蛋白VP1的H-2Dd、H-2Kd、H-2Ld、A20限制性T细胞表位进行预测,并对不同限制性的T细胞表位进行对比。结果表明,口蹄疫AF/72株结构蛋白VP1长639bp,编码213个氨基酸。不同限制性的T细胞表位虽然不尽相同,但与已鉴定的T细胞表位相比较,它们之间也有一些类似的、并且可能是通用型的T细胞表位。本试验通过生物信息学方法预测AF/72结构蛋白VP1的T细胞表位,为进一步试验确定T细胞表位和口蹄疫病毒T细胞表位的研究提供了一种有效的方法。同时为口蹄疫病毒表位疫苗的设计提供有效地理论基础。

分类号： S852.65

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