光照胁迫下广叶绣球菌菌丝基因差异表达的初步分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 肖冬来

作者： 肖冬来;张迪;马璐;王宏雨;林衍铨

作者机构：

关键词： 广叶绣球菌;转录组;GO功能分析;差异表达基因

期刊名称： 中国食用菌

ISSN： 1003-8310

年卷期： 2017 年 36 卷 05 期

页码： 60-63

摘要： 利用高通量测序技术对黑暗和光照下广叶绣球菌(Sparassis latifolia)菌丝进行RNA-Seq分析,比较光照胁迫下的差异表达基因,并对差异基因进行GO功能分析和KEGG pathway分析。结果表明,光照胁迫下显著性差异表达的基因328个,其中,上调、下调表达的基因数分别为157个和171个。差异表达基因的GO注释表明,生物学过程主要为细胞过程、代谢过程、单一生物过程,而分子功能主要为催化、结合和转运子活性。KEGG pathway功能分析结果表明,差异基因主要集中在次级代谢产物合成、淀粉和蔗糖代谢和谷胱甘肽代谢通路中。

分类号： S646

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