利用mtDNA D-loop序列为遗传标记分析槟榔江水牛的群体遗传特征

文献类型： 中文期刊

第一作者： 苗永旺

作者： 苗永旺;李大林;袁峰;梁建平;李卫真;刘伟;李卓然;章纯熙

作者机构：

关键词： 槟榔江水牛;mtDNA D-loop;遗传多态性;遗传分化;基因渗入

期刊名称： 云南农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1004-390X

年卷期： 2011 年 26 卷 05 期

页码： 625-632

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 槟榔江水牛是近年在云南西部发现的中国第一个本土河流型水牛群体,具有较高种用价值,但其重要遗传背景信息还不清楚。本文采用PCR产物直接测序法对86头槟榔江水牛mtDNA D-Loop序列进行了突变检测,并以GenBank上已发表的70条河流型和112条沼泽型水牛mtDNA D-Loop序列为对照,对所得数据进行群体遗传和系统发育分析。结果在槟榔江水牛中检测到33种单倍型,112个多态位点。其中单一变异位点14个,简约信息位点98个。槟榔江水牛mtDNA D-Loop序列T,C,A,G的平均含量分别为28.43%,24.82%,31.96%,14.79%,单倍型多样度为(0.948±0.012),核苷酸多样度为(0.038 1±0.001 6),序列间平均核苷酸差异数为33.288,群体内平均遗传距离为(0.043±0.005)。系统发育、中介网络图和群体遗传关系分析表明,槟榔江水牛含有两个差异显著的母系世系组分,其中一个为河流型世系,在群体中占61.63%;另一个为沼泽型世系,在群体中占38.37%,而其沼泽型世系可进一步分为A,B,C 3个支系,其中,C为在水牛中新发现的支系,其频率极低。结果揭示了槟榔江水牛群体遗传多样性丰富,但该群体存在一定的沼泽型水牛基因渗入。

分类号： S823.83

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