山西猪瘟野毒株E_2基因序列测定与遗传变异多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 姚敬明

作者： 姚敬明;孟帆;雷宇平;吴忻;王娟萍;刘文俊;韩一超;樊振华;张瑞琴;米瑞娟

作者机构：

关键词： 山西猪瘟野毒株;E2基因;序列分析

期刊名称： 中国兽医学报

ISSN： 1005-4545

年卷期： 2014 年 34 卷 09 期

页码： 1405-1410

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解山西地区猪瘟病毒(CSFV)流行毒株的遗传变异情况,采用RT-PCR方法,2013年从山西部分地区分离出5株CSFV流行毒株,并进行了E2全基因扩增、克隆与序列测定,应用DNAStar分析软件对所测定的5株毒株与国内外参考毒株的相应序列进行了同源性分析,绘制系统发育进化树。结果表明:5株CSFV流行毒株之间E2基因核苷酸序列与所推导氨基酸序列的同源性分别为81.4%~100%和87.9%~100%,与CSFV石门毒株(Shimen株)的核苷酸与氨基酸的同源性分别为82.9%~94.8%和89.0%~94.9%,与CSFV兔化弱毒株(HCLV株)的核苷酸与氨基酸的同源性分别为81.6%~99.6%和87.9%~99.5%,与17株来自各国不同地区的CSFV参考毒株的核苷酸与氨基酸的同源性分别为81.5%~99.6%和86.3%~99.7%。经系统发育关系分析,4株属于基因2群,且705、713、725、729、734和738位氨基酸发生置换,另外1株属于基因1群。本研究揭示了山西猪瘟流行毒株的遗传变异多样性现状。

分类号： S852.65

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