陆地棉磷高效基因GhMGD3的克隆与表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 孟超敏
作者: 孟超敏;耿翡翡;卿桂霞;周佳敏;张富厚;刘逢举
作者机构:
关键词: 陆地棉;低磷胁迫;基因克隆;表达分析
期刊名称: 浙江农林大学学报
ISSN: 2095-0756
年卷期: 2022 年 39 卷 006 期
页码: 1203-1211
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: [目的]基于前期陆地棉Gossypium hirsutum根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列数据分析,挖掘相关基因,并对其克隆与表达分析.[方法]克隆GhMGD3基因并进行基因组DNA与cDNA测序分析,借助生物信息学方法分析GhMGD3的基因结构和进化关系;采用半定量RT-PCR技术与实时荧光定量PCR(RT-qPCR)的方法检测该基因在根、茎、叶、花4个组织中的基因表达量的变化以及低磷胁迫下的表达模式.[结果]成功克隆了陆地棉GhMGD3基因.GhMGD3基因的编码序列全长为681 bp,共编码226个氨基酸,存在3个内含子,分子量是26610.54 Da,等电点为8.74,是稳定的亲水碱性蛋白.二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主.该蛋白不存在信号肽、跨膜结构域、N-糖基化位点,但含有多个磷酸化位点.亚细胞定位结果显示:该基因编码的蛋白定位于叶绿体.GhMGD3蛋白与木槿Hibiscus syriacus氨基酸序列相似性较高,其亲缘关系最近.半定量RT-PCR和RT-qPCR试验结果均表示:GhMGD3基因主要表达于根,中量表达于茎,微量表达于叶和花,在低磷胁迫72 h时其相对表达量达到最高值.[结论]首次成功克隆到了陆地棉GhMGD3基因,获得了GhMGD3基因的组织表达以及低磷胁迫下的表达模式,GhMGD3基因在棉花磷高效利用信号调控中具有重要作用.
分类号: S33%Q78
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