香蕉中Maasr1基因的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵宏亮

作者： 赵宏亮;冯仁军;苏伟;徐碧玉;金志强

作者机构：

关键词： Maasr1基因;生物信息学;结构与功能;预测

期刊名称： 生物技术通讯

ISSN： 1009-0002

年卷期： 2006 年 17 卷 03 期

页码： 336-340

摘要： 目的:利用生物信息学方法对香蕉中Maasr1基因的理化性质、结构与功能进行预测,为其基因功能的研究提供线索,为下一步的实验策略提供参考。方法:用Protparam分析Maasr1编码蛋白的氨基酸序列组成、相对分子质量、等电点等理化性质;用InterProScan分析蛋白质结构域;用Scanprosite寻找Motif;用Predictprotein预测二级结构、疏水性;用Psort进行亚细胞定位;用ClustalW进行多序列比对;用Protfun分析蛋白质功能。结果:通过因特网数据库及生物信息学分析工具进行初步分析表明,Maasr1基因编码的蛋白是一种相对分子质量为16263.8、等电点为5.99的不稳定蛋白,富含Glu、Ala、His、Lys;二级结构主要是α螺旋,具有多种蛋白激酶磷酸化位点和1个豆蔻酰化位点,并具有很高的亲水性,定位于细胞核和细胞质。结论:Maasr1基因可能在植物的糖代谢、生长衰老、果实发育及非生物胁迫过程中起重要作用。

分类号： S668.1

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