不同类型鸡趾长伸肌中基因表达谱差异分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 章明

作者： 章明;束婧婷;屠云洁;姬改革;单艳菊;盛中伟;张笛;邹剑敏

作者机构：

关键词： 清远麻鸡;科宝肉鸡;肌纤维;差异表达基因;表达谱芯片

期刊名称： 扬州大学学报(农业与生命科学版)

ISSN： 1671-4652

年卷期： 2016 年 37 卷 03 期

页码： 47-53

收录情况： 北大核心

摘要： 采用Agilent鸡全基因组表达谱芯片对生长速度较慢的慢速型地方鸡品种清远麻鸡和生长速度较快的快大型肉鸡科宝500肉鸡趾长伸肌中与肌纤维生长发育相关的候选基因及信号通路进行系统筛查,以期探究其差异机制。结果表明:芯片分析共筛选到差异倍数在2倍及以上的基因1 225个,以科宝肉鸡为参照,清远麻鸡中482个基因上调,743个基因下调。选取7个差异表达基因进行qRT-PCR,对芯片结果进行了验证。基于KEGG Pathway分析发现,差异基因除参与肌纤维生长发育和分化相关信号通路(如Ca2+信号通路和Hedgehog信号通路)外,MAPK信号通路、Wnt信号通路、JAK-STAT信号通路、ErbB信号通路、脂肪酸合成信号通路等一些与能量代谢相关的信号通路也被富集为显著的信号通路。根据GO及KEGG Pathway分析结果,发现了23个基因可能与鸡肌纤维生长发育相关,这些基因在肌纤维生长发育过程中的作用尚有待深入研究。

分类号： S831.2

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