猪细环病毒1b型ORF3基因克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 胡崇伟

作者： 胡崇伟;陈如敬;陈秋勇;林群群;陈鹏强;修金生

作者机构：

关键词： 猪细环病毒1b型;ORF3基因;序列分析

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2014 年 41 卷 08 期

页码： 76-80

收录情况： 北大核心

摘要： 为明确福建省猪细环病毒(porcine torque teno sus virus,PTTSuV)1b型(PTTSuV-1b)ORF3基因的遗传进化特征,本研究根据GenBank中登录的PTTSuV-1b基因组特征设计特异性引物,对福建省某猪场患有仔猪断奶后多系统衰竭综合征(PMWS)的猪血清进行PTTSuV-1b分段扩增,并分别对PCR扩增产物进行胶回收后克隆测序,将测序结果经BLAST分析后进行序列拼接。试验结果表明,所扩增的目的片段编码有完整的PTTSuV-1bORF3蛋白,全长为600bp,编码有199个氨基酸。将获得的PTTSuV-1b型福建株与GenBank中PTTSuV-1b型的ORF3基因进行比对分析,其与FJ/China/2010/TTV2/2株核苷酸同源性最高,为99.7%,与西班牙PTTSuV-1b分离株TTV2_G43核苷酸同源性为97.3%,与SC株核苷酸同源性稍低,但也达94.0%;而与猪细环病毒K2型德国家猪分离株472142株核苷酸同源性仅为60.7%,与猪细环病毒1a型西班牙分离株PTTV1_1914株核苷酸同源性仅为46.8%。从遗传进化关系上看,PTTSuV-1bORF3基因在遗传进化上呈2个大的遗传进化分支(分支Ⅰ和分支Ⅱ),本研究分离株处于分支Ⅰ。

分类号： S852.65

  • 相关文献

[1]猪流行性腹泻病毒变异株GDqy2017的分离及S和ORF3基因序列分析. 楚品品,蒋智勇,林德锐,徐志宏,李艳,勾红潮,卞志标,李春玲,蔡汝健. 2018

[2]鹅圆环病毒JX1株ORF3基因序列分析. 万春和,黄瑜. 2020

[3]2014年部分地区猪流行性腹泻病毒流行病学调查. 常铁城,陈建飞,冯力,倪宏波. 2016

[4]猪流行性腹泻病毒FJ-11A株的分离与ORF3基因序列分析. 陈如敬,吴学敏,车勇良,王隆柏,魏宏,庄向生,严山,周伦江. 2011

[5]新发猪流行性腹泻病毒分子变异分析. 訾玉华,张春玲,史仲平,李春华,何锡忠,周宗清,张婉华,蒋凤英,彭丽英. 2013

[6]猪流行性腹泻病毒ORF3和M基因的克隆与序列分析. 王隆柏,吴学敏,车勇良,陈如敬,魏宏,刘玉涛,庄向生,周伦江. 2012

[7]猪流行性腹泻病毒山西分离株ORF3基因序列分析. 刘文俊,王娟萍,姚敬明,吴忻,孟帆,韩一超,樊振华,薛翼鹏,米瑞娟,李红丽,赵岳. 2017

[8]猪戊型肝炎病毒swCH196株ORF3基因的克隆与序列分析. 杨敏,郝宝成,兰喜,柳纪省. 2010

[9]我国华东地区猪流行性腹泻病毒ORF3基因的遗传变异分析. 邓小红,余伟权,李彬,孙冰,徐向伟,刘浩飞,何孔旺,郭容利,俞正玉. 2015

[10]猪繁殖与呼吸综合征病毒兰州分离株ORF3基因的克隆及杆状病毒载体的构建. 赵娜,田宏,祁燕蓉,满自萍,吴锦艳,尚佑军,何生虎,刘湘涛. 2009

[11]新疆石河子部分地区猪流行性腹泻病毒遗传变异分析. 黄新,吴桐忠,韩猛立,张星星,何延华,钟发刚. 2019

[12]猪流行性腹泻病毒RT-PCR鉴别诊断方法的建立. 吴玉璐,程群,虞凌雪,侯怡轩,王康,刘光清,童光志,周艳君. 2013

[13]猪流行性腹泻病毒S、N和ORF3基因的遗传变异分析. 王隆柏,林裕胜,车勇良,吴学敏,陈如敬,邵良平,周伦江. 2014

[14]猪圆环病毒2型ORF3基因的表达及其表达产物免疫小鼠后致细胞因子变化的研究. 王亚军,杨顺利,才学鹏. 2013

[15]我国长江流域PRRSV ORF3基因的遗传变异分析. 李彬,何孔旺,温立斌,茅爱华,王小敏,张雪寒,倪艳秀,周俊明,肖少波,陈焕春. 2011

[16]猪流行性腹泻病毒的分子流行病学研究. 陈建飞,王承宝,时洪艳,陈小金,张志榜,冯力. 2010

[17]新发猪流行性腹泻病毒ORF3基因的遗传进化分析. 董世娟,朱于敏,于瑞嵩,司伏生,石明明,张源淑,李震. 2014

[18]猪圆环病毒2型SD2分离株ORF3基因转录分析. 丁鹏,李俊,于周,程凯慧,吴家强,王金宝. 2009

[19]2011-2012年我国部分地区猪流行性腹泻病毒ORF3基因的遗传变异分析. 郭容利,何孔旺,茅爱华,刘浩飞,俞正玉,倪艳秀,温立斌,李彬,王小敏,张雪寒,吕立新,周俊明. 2013

[20]2011—2016年浙江省猪流行性腹泻病毒S基因与ORF3基因遗传进化分析. 吴旺霞,王一成,吴润,袁秀芳,徐丽华. 2017

作者其他论文 更多>>

微信小程序