基于宏基因组测序对中国北方地区生乳中嗜冷菌的群落结构研究

文献类型: 中文期刊

第一作者: 许文君

作者: 许文君;郑楠;王加启;孟璐

作者机构:

关键词: 生乳;嗜冷菌;宏基因组测序;地区;结构

期刊名称: 畜牧兽医学报

ISSN: 0366-6964

年卷期: 2024 年 008 期

页码: 3659-3668

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究旨在利用宏基因组测序探究中国北方地区生乳中嗜冷菌群落结构的多样性。在冬季从中国内蒙古地区和北京地区的14个牧场共采集14份生乳样品,分离纯化可培养嗜冷菌和提取生乳中微生物总DNA,并利用16S rDNA测序和宏基因组测序结合的方法对生乳中嗜冷菌进行分析。结果发现,北京地区和内蒙古地区生乳中嗜冷菌的群落结构无显著性差异。两个地区生乳中优势嗜冷菌属均是假单胞杆菌属、寡养单胞菌属和短波单胞杆菌属。全局和概述图谱、氨基酸代谢和碳水化合物代谢是最主要的功能代谢途径,且嗜冷菌中含有多种抗生素抗性基因。综上,本研究利用传统培养和宏基因组测序准确测定了生乳中嗜冷菌群落的物种和功能信息,有助于了解生乳中嗜冷菌的生命活动及为嗜冷菌风险评估提供基础信息,促进中国北京及内蒙古牧场开展防控。

分类号: TS252.1

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