低温胁迫下民猪骨骼肌的转录调控分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张冬杰

作者： 张冬杰;汪亮;马红;李忠秋;王文涛;刘娣

作者机构：

关键词： 民猪;骨骼肌;低温胁迫;RNA-seq;lncRNA

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2022 年 008 期

页码： 2524-2536

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了揭示民猪优良种质特性的遗传机理，解析其低温适应机制。本试验将6头6月龄体重相近的雌性民猪随机分成2组，每组3头个体。对照组个体置于温度控制在（18±2）℃的猪舍内，试验组个体置于室外的半敞篷舍内饲养，环境温度从第1天的5℃/-5℃降到最后1天的-15℃/-24℃,共处理了58 d。两组个体均保证自由采食和饮水，试验结束后，屠宰全部个体，取背最长肌进行RNA-seq。筛选民猪骨骼肌受低温诱导的基因和lncRNA,并对它们进行功能注释以及两者间调控关系的分析。RNA测序分析显示，民猪在经历58 d的低温胁迫后，骨骼肌内86个基因发生了显著上调，16个基因发生了显著下调；112个lncRNAs发生了显著上调，74个lncRNAs发生了显著下调。在发生显著上调的基因中，有4个与神经系统相关的基因NTSR2、ARC、FOSL1和RCAN1发生了显著上调，7个与基质转运相关的基因SLC2A4、SLC2A5、SLC4A10、SLC19A2、SLC20A1、SLC28A1和SLC38A2,6个与炎症和免疫相关的基因AREG、CISH、OTUD1、TRIB1、GPA33和ITPKC均发生了显著上调。而与昼夜节律相关的ARNTL基因和抑制细胞增殖的RASL11A基因等发生了显著下调。低温胁迫下，差异表达基因显著富集到细胞凋亡、直肠癌和癌症的转录误调节通路，说明细胞的增殖和凋亡受到影响。显著变化的lncRNA主要以反式调控作用于靶基因，且与靶基因间的互作关系复杂，它们调控的靶基因富集到单纯疱疹病毒1感染通路、MAPK信号通路和范可尼贫血通路。此外，再无其他通路受到影响。低温胁迫影响了民猪的神经和免疫系统，使细胞内的物质转运发生了变化，细胞的生长、分化也受到了影响，但由于基因发生变化的倍数较小（1～2倍为主）,且受影响的通路较少（仅3条）,因此推测低温胁迫并未对民猪的骨骼肌造成严重损伤。

分类号： S828.2

  • 相关文献

[1]重度冷应激下民猪背最长肌应答分子调控网络分析. 马守正,汪亮,李忠秋,王文涛,刘娣,张冬杰. 2022

[2]12个lncRNA在发生炎症反应仔猪骨骼肌和肝脏组织中的表达分析. 张琳,赵为民,王胜军,刘玉兰,张晶. 2017

[3]冷应激后民猪背脂中差异lncRNA的筛选与分析. 马骏杰,汪亮,刘娣,张冬杰,杨秀芹. 2021

[4]绵羊季节性发情性状核心基因和关键lncRNA的筛选与分析. 杨杨,李良远,万鹏程,卢守亮,刘长彬,杨华,王立民,代蓉,周平. 2025

[5]利用WGCNA方法分析猪胚胎期骨骼肌发育相关共表达网络的研究. 岳静伟,崔雪霞,王立贤,张龙超. 2022

[6]低温对民猪骨骼肌线粒体能量代谢基因的影响. 张冬杰,马守正,汪亮,李忠秋,刘娣. 2024

[7]民猪骨骼肌对低温环境的应答反应. 张冬杰,马守正,汪亮,李忠秋,刘娣. 2024

[8]鸭胚胎期胸肌miRNA-mRNA的关联分析. 顾丽红,林哲敏,邢漫萍,刘圈炜,叶保国. 2017

[9]木薯中lncRNA-CRR5在低温胁迫下的功能分析. 沈婕,董世满,李淑霞,彭明. 2021

[10]民猪与皮特兰猪杂交猪肉质研究. 何鑫淼,刘娣. 2013

[11]植物非编码RNA及其在甜菜中的应用研究. 李任任,吕春华,於丽华,耿贵. 2019

[12]畜禽动物中长链非编码RNA的研究现状. 戴梦红,陆启荣,程古月,李丽,刘孟轲,郝海红,王旭,袁宗辉. 2016

[13]植物长链非编码RNA的生物学功能研究进展. 李宁,王柏柯,王娟,黄少勇,戴麒,帕提古丽,高杰,余庆辉. 2019

[14]植物逆境相关长链非编码RNA的研究进展. 郑佳秋,吴永成,王薇薇,梅燚,祖艳侠,郭军,刘云芬. 2020

[15]LncRNA9606对猪流行性腹泻病毒复制的影响. 燕苗苗,陈佳宁,刘光亮. 2020

[16]基于转录组学筛选与哺乳动物睾丸发育相关基因及调控网络的研究进展. 孙武,罗静,李发弟,李万宏,乐祥鹏. 2018

[17]猪PAANCR组织表达谱分析及其对脂质生成的影响. 王璟,李庆东,滑留帅,陈俊峰,张家庆,任巧玲,刘付玖,张华,曹海,徐照学,邢宝松,白献晓. 2019

[18]细粒棘球绦虫原头蚴lncRNA表达谱分析. 王正荣,张艳艳,马勋,刘乙,徐梦飞,孟季蒙,薄新文. 2019

[19]苏尼特羊不同生长时期肌肉组织lncRNA的差异表达分析. 王瑞雪,刘佳森,李蕴华,成立新,岳林芳,马万山,赵艳红. 2021

[20]LncRNA对胚胎发育的影响. 张燕迪,任红艳,毕延震. 2021

作者其他论文 更多>>

微信小程序