脊尾白虾丝氨酸羟甲基转移酶基因的克隆及其表达特征分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙金秋

作者： 孙金秋;徐莞媛;马杭柯;高威;欧阳乐飞;高焕;阎斌伦

作者机构：

关键词： 脊尾白虾;丝氨酸羟甲基转移酶基因;基因克隆;组织表达;Cd2+胁迫

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN： 2095-9869

年卷期： 2020 年 01 期

页码： 127-134

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究根据脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)转录组序列,采用c DNA末端快速扩增技术克隆获得了脊尾白虾丝氨酸羟甲基转移酶基因(SHMT)。该基因c DNA全长为1855 bp,其中,开放阅读框为1407 bp,5?端非编码区为39 bp,3?端非编码区为409 bp,共编码468个氨基酸,预测蛋白质的分子质量为152.55 kDa,理论等电点为4.90。同源性分析显示,脊尾白虾SHMT基因与甲壳类动物真宽水蚤(Eurytemora affinis)同源性最高,为96%。荧光定量分析结果显示,SHMT基因在脊尾白虾眼柄、胃、肝胰腺、心脏、鳃、肠、肌肉、腹索神经、皮下脂肪以及卵巢中均有表达,其中,卵巢表达量最高,心脏次之。不同浓度Cd2+胁迫结果显示,其在低浓度(0.0100、0.0175和0.021 mmol/L)Cd2+胁迫中的表达模式基本一致,呈先升高后下降再升高再下降的趋势;而在高浓度(0.0278 mmol/L)Cd2+胁迫中,该基因表达量很低,甚至不表达,说明高浓度Cd2+胁迫可以抑制该基因的表达,具体机制有待进一步研究。

分类号： S917.4

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