旋毛虫组织蛋白酶B基因TsCB1的克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 谢志宙

作者： 谢志宙;李文卉;曲自刚;刘静宜;高小磊;岳龙;张德林;付宝权

作者机构：

关键词： 旋毛虫;组织蛋白酶B;克隆;生物信息学分析

期刊名称： 中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2013 年 07 期

页码： 661-667

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究旋毛虫组织蛋白酶B的功能,对GenBank中旋毛虫基因组数据库和EST数据库进行检索,获得旋毛虫组织蛋白酶B的cDNA序列并设计引物。以旋毛虫肌幼虫总RNA为模板,进行RT-PCR,将PCR产物克隆到pMD18-T载体后测序并进行生物信息学分析。结果表明,成功克隆到旋毛虫组织蛋白酶B基因(TsCB1)的cDNA序列,TsCB1cDNA含有1个由1 449个核苷酸组成的完整的开放阅读框,编码482个氨基酸残基组成的多肽,蛋白质分子质量理论值为55.1ku,理论等电点为7.66。TsCB1第1～35位氨基酸残基为信号肽序列,有2个潜在的N-糖基化位点,具有1个生长调节素B结构域和半胱氨酸蛋白酶结构域,半胱氨酸残基活性位点被丝氨酸残基所替换,同源性分析表明与其他线虫组织蛋白酶B的一致性在60%左右。

分类号： S852.731

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