巴西橡胶树HbUBC5基因克隆、生物信息学及表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李德军
作者: 李德军;刘向红;邓治;刘辉
作者机构:
关键词: 巴西橡胶树;泛素接合酶;基因克隆;表达分析
期刊名称: 天津农业科学
ISSN: 1006-6500
年卷期: 2014 年 20 卷 07 期
页码: 6-10
摘要: 为研究巴西橡胶树泛素结合酶(UBC)基因功能,采用PCR技术从巴西橡胶树中克隆了一个UBC基因,用半定量RTPCR分析基因表达模式,同时对基因编码蛋白进行生物信息学分析。结果表明,基因长681 bp,最长开放阅读框555 bp,预测编码蛋白包含184个氨基酸;序列比对分析发现,该基因编码的蛋白具有一段保守的UBC结构域,与拟南芥E2成员UBC5(At1g63800)具有较高的相似性,故将该基因命名为HbUBC5。半定量RT-PCR分析结果表明,HbUBC5在巴西橡胶树胶乳中表达最高,在树皮中表达最低。HbUBC5在叶片不同发育时期表达模式存在变化,在古铜期最低,在稳定期最高。与健康橡胶树相比,死皮树胶乳中HbUBC5表达量明显下降。HbUBC5表达还受乙烯和茉莉酸调控。以上结果表明,HbUBC5可能在巴西橡胶树死皮、产排胶、乙烯和茉莉酸反应中发挥作用。
分类号: S794.1
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