甘薯储藏期低温胁迫的转录组分析和关键基因挖掘

文献类型： 中文期刊

第一作者： 肖世卓

作者： 肖世卓;张毅;戴习彬;周志林;孙健;曹清河

作者机构：

关键词： 甘薯;储藏;低温胁迫;转录组;类受体蛋白激酶

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN：

年卷期： 2024 年 007 期

页码： 1163-1174

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 甘薯在储藏过程中受到低温冷害会大大降低甘薯的商品价值,因此研究甘薯耐低温储藏的分子机制,减少低温在甘薯储藏过程中的影响具有重要意义.本研究选取了较耐低温储藏、不耐低温储藏以及表现居中的3个甘薯品种商薯19(S19)、烟薯25(Y25)和苏薯16(S16),分别在9℃和6℃储藏35 d.提取上述处理的薯块总RNA进行转录组测序和比较分析,发现与对照相比,S19在低温储藏后的差异表达基因较少,而Y25则相反,S16居中.差异表达基因KEGG和GO分析发现,甘薯块根在低温胁迫下蛋白酶体相关基因的表达水平较高.最终,通过比较不同品种不同温度下的转录组数据,得到响应储藏期低温胁迫的候选基因Ibat.Brg.02F_G010830,该基因注释为冷胁迫响应类受体蛋白激酶.qRT-PCR验证该基因的表达与转录组数据相一致.进一步分析了该基因及其等位基因和同源基因的进化关系,并分析了该基因在不同品种中的变异.本研究将为甘薯低温储藏响应机制解析以及耐低温储藏品种的选育提供支撑.

分类号： S53

  • 相关文献

[1]低温胁迫下苦瓜叶片转录组差异基因分析及生理响应特征. 杜文丽,陈中钐,许端祥,徐同伟,高山,温庆放. 2021

[2]低温诱导稻曲病菌菌核形成的转录组学分析. 吕楚阳,邓平川,张晓丽,孙钰超,梁五生,胡东维. 2020

[3]低温胁迫下两叶一心期棉花叶片的生理响应和转录组分析. 王晓曼,王琼珊,王孝刚,张教海,张友昌,张兴中,别墅,夏松波. 2020

[4]低温胁迫下海滨木槿的转录组分析. 赵文静,郑旭,葛金涛,刘兴满,缪美华,孔祥伟. 2023

[5]紫花苜蓿响应低温胁迫转录因子的鉴定及表达分析. 齐晓,闵学阳,张正社,孙启忠,刘文献. 2017

[6]基于转录组分析筛选凡纳滨对虾低温胁迫下的差异表达基因. 董丽君,孟宪红,孔杰,罗坤,栾生,史晓丽. 2019

[7]木豆响应低温胁迫差异表达基因分析. 唐军,丁西朋,陈志坚,马向丽,毕玉芬,郭凤根. 2022

[8]转录组和蛋白质组关联分析解析巴西蕉幼苗响应低温的分子机制. 林蔚,吴水金,李跃森. 2024

[9]水稻幼苗期低温胁迫的生理响应及转录组分析. 郭慧,李树杏,甘雨,张宏伟,郝留根,杨占烈,向关伦,王珍珍,易崇粉. 2023

[10]猕猴桃'脐红'与'徐香'越冬期转录组的比较分析. 毛可欣,王海荣,安淼,吕巍,李健,李国田. 2023

[11]秋茄低温胁迫转录组分析及脱落酸信号途径基因挖掘. 郭晋敏,杨升,刘星,王金旺,王文卿,陈秋夏. 2023

[12]甘薯低温胁迫基因IbICE1的克隆及表达分析. 于涛,周桦楠,张海楼,叶鑫. 2017

[13]低温胁迫影响甘薯贮藏的研究进展. 解则义,李洪民,马代夫,陈天娇,韩永华. 2017

[14]甘薯丝裂原活化蛋白激酶MPK6对低温胁迫的响应. 靳容,刘明,赵鹏,张强强,张爱君,唐忠厚. 2021

[15]腐皮镰刀菌侵染甘薯的转录组分析. 罗勤川,唐伟,马居奎,陈晶伟,杨冬静,高方园,孙厚俊,谢逸萍,张成玲. 2023

[16]叶面喷施丹参碳点缓解甘薯低磷胁迫的转录组与代谢组学分析. 朱晓亚,张强强,赵鹏,刘明,王静,靳容,于永超,唐忠厚. 2024

[17]基于转录组测序数据的甘薯SSR标记开发及群体聚类分析. 杨育峰,史典义,王雁楠,杨国红,徐心志,翟红,何绍贞,刘庆昌,苏文瑾. 2018

[18]转录组与代谢组联合分析揭示遮阴胁迫下甘薯的代谢响应途径. 王雁楠,陈金金,卞倩倩,胡琳琳,张莉,尹雨萌,乔守晨,曹郭郑,康志河,赵国瑞,杨国红,杨育峰. 2023

[19]甘薯响应冷胁迫的转录组分析. 周桦楠,潘家荃,刘冠求,万博,王凯,于涛. 2022

[20]水稻类受体蛋白激酶OsESG1的原核表达. 赵丽,张国嘉,郑世刚,李臻,王庆国,潘教文,刘炜. 2015

作者其他论文 更多>>

微信小程序