槟榔AcAAP3基因cDNA克隆及其组织表达特性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李佳

作者： 李佳;曹先梅;谢赛;刘立云

作者机构：

关键词： 槟榔;氨基酸通透酶(AAP3);基因克隆;生物信息学;组织表达

期刊名称： 南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2019 年 50 卷 02 期

页码： 215-221

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】克隆槟榔氨基酸通透酶(AAP3)基因(AcAAP3),分析其生物学信息,并检测其组织表达特性,为探究AAP3在氨基酸转运及氮素利用机制提供理论依据。【方法】利用反转录PCR(RT-PCR)从槟榔品种热研1号中扩增AcAAP3基因cDNA序列,利用生物信息学方法对其编码蛋白的理化性质、亲疏水性、亚细胞定位、功能域及二、三级结构等进行预测分析,并利用实时荧光定量PCR检测AcAAP3基因在槟榔根、叶、茎、雄花和雌花中的表达特异性。【结果】克隆获得AcAAP3基因cDNA序列全长为1440 bp,编码479个氨基酸,蛋白理论分子量为52.834 kD,等电点(pI)为8.76,具有9个跨膜结构域,定位在细胞质膜上,为疏水性非分泌蛋白,具有1个保守的PF01490结构域(氨基酸转运结构域Aa_trans),属于氨基酸转运蛋白家族和APC超家族成员,其二级结构主要由α螺旋(45.72%)和不规则卷曲(34.66%)构成。AcAAP3蛋白氨基酸序列与椰枣(XP008799058.1)、油棕(XP010912574.1)、香蕉(XP009404321.1)和菠萝(XP020107563.1)AAPs蛋白的氨基酸序列相似性分别为91%、90%、84%和83%,说明不同植物的AAPs蛋白具有高度保守性。植物AAPs蛋白家族可分成两个亚类,即单子叶亚类和双子叶亚类,其中,AcAAP3蛋白与单子叶亚类的椰枣(XP008799058.1)和油棕(XP010912574.1)AAPs的亲缘关系较近。AcAAP3基因在槟榔各组织均有表达,表达量依次为根>叶>茎>雄花>雌花。【结论】AcAAP3基因具有明显的组织特异性,其编码蛋白可能在槟榔从外界吸收氨基酸及其体内氨基酸转运中发挥重要作用。

分类号： S792.91

  • 相关文献

[1]暗纹东方鲀sox9基因的克隆和组织表达分析. 高莹莹,刘新富,胡鹏,刘滨,郭正龙. 2019

[2]牦牛SMPX基因CDS区克隆及组织表达分析. 郭梁,王吉坤,王会,柴志欣,信金伟,姬秋梅,钟金城. 2019

[3]绵羊BTG2基因CDs区克隆、生物信息学分析及组织mRNA表达研究. 高一,刘理想,肖成,金海国,马惠海,薛佳佳,魏天,曹阳. 2021

[4]暗纹东方鲀芳香化酶基因的结构及表达分析. 高莹莹,刘新富,胡鹏,黄滨,刘滨. 2020

[5]暗纹东方鲀抗苗勒氏管激素Ⅱ型受体基因的克隆、生物信息学及表达分析. 高莹莹,胡鹏,刘新富,黄滨,刘滨. 2019

[6]延边黄牛ASB12基因的序列分析及组织表达分析. 田万年,张亚丽,郑秀红,李香子,夏广军. 2016

[7]猪雄性增强抗原1基因MEA1编码区克隆、表达及生物信息学分析. 霍海龙,张霞,范俐,赵筱,唐宏涛,高林青,王世雄,杨云,浦仕飞,刘丽仙. 2018

[8]瓠瓜KNOX基因家族全基因组鉴定及组织表达分析. 徐晓燕,黄小忠,刘万仙,张曼. 2024

[9]番茄C2H2型锌指蛋白的鉴定及生物信息学分析. 胡军华,王大伟,杨明磊,王新,朱海,朱佩,刘贯山. 2018

[10]美仁牦牛MYL9基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究. 马荣,喇永福,包鹏甲,郭宪,路建卫,扎老,赵雪,梁春年,成述儒. 2024

[11]绵羊卷曲受体1基因克隆、表达谱与多态性分析. 张双双,贾琪,王丹,王卓,柳俭强,张立春,戢爽. 2023

[12]清远麻鸡miR-142-3p分析及其关键靶基因的筛选. 朱师良,余春林,邱莫寒,张增荣,熊霞,胡陈明,杨礼,彭涵,陈家磊,宋小燕,夏波,杨朝武. 2024

[13]槟榔Catalase基因的克隆及亚细胞定位. 梁婷,沈文涛,庹德财,言普,黎小瑛,唐庆华,周鹏. 2020

[14]罗氏沼虾组织蛋白酶D基因的克隆及其组织表达分析. 张夏青,许建和,潘茜,易乐飞,彭永兴,高焕,阎斌伦,王姗,韩振,程汉良. 2016

[15]猪CD4基因编码区及其剪接体克隆与表达分析. 许金根,张勤,王立克,任曼,李升和,王重龙. 2016

[16]三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)几丁质酶PtCht3基因克隆鉴定及表达分析. 张凤,吕建建,刘萍,高保全,李健. 2017

[17]小体鲟AR基因克隆、序列分析及其组织mRNA表达. 余晶,董晓丽,张颖,刘晓勇,潘鹏,买丽坎,孙大江. 2014

[18]中国明对虾MKK3基因cDNA克隆及其在氨氮胁迫下的表达. 姚万龙,何玉英,刘萍,李健,王清印. 2016

[19]ICR小鼠Mxl基因的克隆及组织表达. 肖志广,刘晓敏,王丽,李巍,王伟,胡卫杰,王建超,孟庆文. 2011

[20]小体鲟卵透明带家族ZP3亚型和ZPAX基因cDNAs克隆及其组织表达分析. 东天,朱华,王巍,董颖,田照辉,胡红霞. 2018

作者其他论文 更多>>

微信小程序