基于InDel标记分析305份中国甘薯登记品种遗传多样性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 唐芬

作者： 唐芬;赵路宽;苏一钧;肖世卓;袁蕊;翁宗宽;戴习彬;周志林;陈艳丽;曹清河

作者机构：

关键词： 甘薯;登记品种;InDel;遗传多样性;群体结构

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2024 年 25 卷 004 期

页码： 936-945

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对甘薯育成品种进行亲缘关系评价,是了解其遗传背景并有效利用种质资源的重要前提.利用本课题组前期开发的23对InDel引物对305份中国甘薯登记品种进行基因型分析,共扩增出56个条带,其中53个条带具有多态性,多态率达94.6%.多态信息量(PIC)、Nei's遗传多样性指数(H)、观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)的平均值分别为0.4098、0.4451、0.6003、0.4460.群体结构分析表明,群体数在K=2时ΔK达到最大值,K=4时有个小高峰;北方薯区和长江流域薯区在2个组群内均匀分布,南方薯区大部分(72.97%)汇聚在组群2.主坐标分析(PCoA)中南方薯区有部分汇聚,整体没有划分出明显的簇群.聚类结果将群体划分为4个主要类群,北方薯区和长江流域薯区的品种在类群Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ中均匀分布,南方薯区主要(77.03%)集中于类群Ⅳ,这一聚类结果与群体结构研究、主坐标分析基本一致.通过系谱分析筛选出登记品种的13个主要亲本材料,各育种单位存在重复利用亲本进行正反交培育的情况.本研究将分子标记结果与系谱信息相结合,初步表明中国甘薯登记品种的亲缘关系较近,遗传背景狭窄,为甘薯的种质创新、新品种选育提供参考.

分类号： S531

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