谷子基因组SSR信息分析和标记开发

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张晗*

作者： 张晗*;王雪梅*;王东建;孙加梅;杨延兵;段丽丽;李华;宋国安;王晓宇;李汝玉

作者机构：

关键词： 谷子;基因组序列;SSR;多态性

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2013 年 11 卷 01 期

页码： 30-36

收录情况： CSCD

摘要： 对从Phytozome数据库中获取的谷子基因组序列进行搜索,在21150.78kb序列中发现2872个SSR,平均每7.36kb就有一个SSR;共发现126种重复基元,其中二核苷酸和三核苷酸类型分别占63.41%和31.86%。初步设计了74对SSR引物,其中64对引物可以稳定扩增。利用40对引物对27份谷子品种进行多态性检验,27对引物扩增良好且多态性丰富,共扩增出220个等位变异,平均每个位点8.15个。

分类号： S515

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