油菜miR156基因家族及其靶基因生物信息学分析及鉴定

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李晓康

作者： 李晓康;刘红芳;刘婧琳;郑明;华玮

作者机构：

关键词： 油菜;miR156;序列分析;分子进化;靶位点序列

期刊名称： 中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2018 年 02 期

页码： 163-173

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为阐明油菜miR156基因家族的进化过程以及与靶基因的作用位点,分析了油菜miR156基因家族的序列特征、进化模式和候选靶基因,共获得35个bna-miR156基因,对应44个成熟序列。这些bna-miR156基因分布在油菜的17条染色体上,其中C3染色体上分布着5个bna-miR156基因。bna-miR156基因在产生成熟序列的区域高度保守,而其它位置保守性较低,进化分析结果显示bna-miR156家族可以分为5个分支,家族成员分布较为分散,位于同一条染色体上的bna-miR156基因并没有表现出更近的亲缘关系。另外,系统发育分析结果显示SBP-box基因在双子叶植物油菜、拟南芥中存在相似的进化模式,进一步发现只有部分BnaSBP家族基因拥有bna-miR156的作用位点,其中30个BnaSBP基因的靶位点位于编码区,11个位于3'UTR。一些拥有bna-miR156作用位点的BnaSBP具有组织表达特异性,因此bna-miR156可能与BnaSBP相互作用,调控油菜生长发育过程。

分类号： S565.4

  • 相关文献

[1]茶毛虫NPV的P24、Rr1、Lef1基因及其分子进化分析. 聂婷婷,肖强,殷坤山,邢丽苹,张传溪. 2005

[2]细茎大豆(G.gracilis)rbcS基因结构与分子进化分析. 张二荃,王喜萍,曹凯鸣,顾其敏,庄炳昌. 1998

[3]小麦tae-MIR156前体基因的克隆及其靶基因TaSPL17多态性分析. 刘霞,张斌,毛新国,李昂,孙美荣,景蕊莲. 2014

[4]椰子开花相关miR156和靶基因SPL特征分析. 冯雅兰,肖勇,王永,张大鹏,石鹏,夏薇,孙熹微. 2022

[5]哈克尼西棉细胞质雄性不育系和保持系花发育不同时期miR156及靶基因TBCC的研究. 吴建勇,邢朝柱,郭立平,戚廷香,王海林. 2013

[6]甘蓝型油菜裂角相关基因BnRPL的克隆与分析. 彭鹏飞,胡琼,李云昌,付丽,陈玉峰,刘佳,梅德圣. 2013

[7]油菜脂肪酸延长酶基因fae1片段的克隆与SNP分析. 肖玲,卢长明. 2005

[8]灰斑古毒蛾核型多角体病毒EcoRⅠ-U片段的克隆与序列分析. 杨丽荣,薛保国,刘红彦,王正军,王秀美. 2009

[9]Dicer蛋白分子的进化与结构研究进展. 刘新建,陶刚,刘永翔,刘作易. 2011

[10]核果类果树ITS序列分子进化及系统发育关系研究. 王化坤,陶建敏,渠慎春,房经贵,马瑞娟,章镇,娄晓鸣. 2010

[11]査尔酮合成酶基因及其分子进化研究进展. 李苗,李国旗. 2015

[12]4株鸭坦布苏病毒包膜蛋白基因的分子进化分析及表达. 张琳,逯茂洋,胡北侠,蒋一男,许传田,杨少华,张贝,张秀美. 2013

[13]葡萄miR159家族生物信息学分析及靶基因预测分析. 葛金涛,王丽丽,赵统利,刘兴满. 2018

[14]蜱螨线粒体基因组研究进展. 袁明龙,王进军. 2012

[15]植物查尔酮合成酶超基因家族组成及分子进化. 李苗,石磊,李国旗. 2016

[16]家蚕、野桑蚕线粒体Cyt b基因片段序列分析及分子进化研究. 李爱玲,徐安英,沈兴家,唐顺明,张志芳,潘沈元. 2004

[17]半翅目昆虫线粒体基因组学研究进展. 郭仲龙,袁明龙. 2016

[18]昆虫视蛋白的研究进展. 段云,吴仁海,苗进,巩中军,李彤,蒋月丽,武予清. 2020

[19]橡胶树内生真菌ITBB2-1的形态学和分子生物学鉴定. 郑鹏,谭德冠,孙雪飘,张家明. 2009

[20]叶绿体atpB-rbcL序列分析在核果类果树系统发育研究中的应用. 王化坤,陶建敏,渠慎春,马瑞娟,房经贵,娄晓鸣,章镇. 2010

作者其他论文 更多>>

微信小程序