乏情和发情初产母猪卵巢microRNA差异表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 任巧玲

作者： 任巧玲;白献晓;王璟;郭红霞;陈俊峰;马文涛;和小娥;张家庆;邢宝松

作者机构：

关键词： miRNAs;乏情;发情;初产母猪;卵巢

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2018 年 05 期

页码： 1153-1162

收录情况： 北大核心

摘要： 为了探索卵巢microRNA(miRNA)在初产母猪生殖调控中的作用,本研究利用Illumina高通量测序技术检测了乏情和发情初产母猪卵巢miRNA的表达谱,并对表达量较高且差异显著的miRNA进行生物信息学分析。结果显示,本研究构建的两个small RNA文库共鉴定出503个miRNAs,其中已知的303个,新预测的200个。在已知的miRNA中,ssc-miR-10b在两个文库中的表达量最高,其次为ssc-miR-143-3p和ssc-miR-26a;在新预测的miRNA中,chr13_2637_mature在两个文库中的表达量最高,其次为chr8_9994_mature。与发情母猪相比,共有145个miRNAs发生显著变化(read counts>10,∣log2(fold-change)∣>1),上调114个,下调31个。在进一步筛选的31个表达量较高且差异显著的miRNAs(read counts>1 000,∣log2(fold-change)∣>1)中,新预测的chr13_2585_mature上调倍数最高,且只在乏情母猪卵巢中表达。31个miRNAs共预测到7 388个靶基因,KEGG信号通路分析显示,有2 788个靶基因注释到了297个KEGG通路,前20个最富集的通路部分与生殖过程或生殖活动调控相关,表明这31个miRNAs参与了初产母猪的生殖调控。本研究结果丰富了猪miRNA数据资源,为进一步深入研究初产母猪的繁殖性能提供了理论依据。

分类号： S828

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