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香蕉查尔酮合酶基因家族生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 胡会刚 1 ; 胡玉林 1 ; 庞振才 1 ; 陈晶晶 1 ; 段雅婕 1 ; 李伟明 1 ; 孙德权 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所农业部热带果树生物学重点实验室

关键词： 香蕉;查尔酮基因家族;生物信息学分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 21 期

页码： 6931-6937

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 查尔酮合酶(chalcone synthase, CHS)是类黄酮合成的关键酶,在类黄酮的合成过程中起重要的作用。为了探索CHS基因家族在调控黄酮类物质合成的功能,本研究对20个香蕉CHS基因家族基因结构、蛋白的基本理化性质、二级结构预测、亚细胞定位、保守基序等方面进行初步生物信息学分析,结果显示:1个香蕉CHS基因没有内含子,大多含有2～3个内含子;20个香蕉CHS蛋白中有6个偏碱性,6个显中性,8个偏酸性;除2个以无规则卷曲为主要构成元件外,香蕉CHS蛋白主要以α-螺旋为主要构成元件;稳定指数分析发现4个CHS蛋白为稳定蛋白;脂溶指数分析表明1个香蕉CHS蛋白为疏水性蛋白;亚细胞定位分析表明大多数CHS蛋白定位于细胞基质,一个分布于细胞核;基序1、基序2、基序3是该家族的保守基序。

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