您好，欢迎访问中国热带农业科学院 机构知识库！
中国热带农业科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

香蕉SUS家族全基因组鉴定及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 吴建阳 1 ; 陈妹 2 ; 罗剑斌 3 ; 胡会刚 2 ; 武爱龙 1 ; 张秀梅 2 ;

作者机构： 1.湛江幼儿师范专科学校

2.农业农村部热带果树生物学重点实验室/中国热带农业科学院南亚热带作物研究所

3.广东茂名农林科技职业学院

关键词： 香蕉;蔗糖合成酶;基因家族;生物信息学

期刊名称： 热带农业科学

ISSN： 1009-2196

年卷期： 2024 年 44 卷 010 期

页码： 25-30

摘要： 蔗糖合成酶(SUS)是植物蔗糖代谢中极其重要的一种酶,既可以催化蔗糖的分解,又可以催化其合成.SUS由多基因家族编码,目前在多个物种中已分离出SUS基因家族全部成员,但香蕉中至今还没有SUS基因家族的报道.本研究利用香蕉基因组,鉴定出 5 个SUS基因,分别命名为MaSUS1~5,不均匀地分布于Chr3、Chr7、Chr8、Chr9 等4 条染色体上,其氨基酸数量为 624~844 aa,蛋白二级结构均主要由 α-螺旋和无规则卷曲组成.亚细胞定位预测分析表明,5 个SUS基因均位于细胞质中;进化树分析发现,MaSUS1 和MaSUS4 属于SUSⅡ亚家族,MaSUS2 和MaSUS5属于SUSⅢ亚家族,MaSUS3属于SUSⅠ亚家族;对其基因结构进行分析发现,外显子数量为12~15,内含子数量为11~14;对其顺式作用元件进行预测发现,光响应元件数量和种类最多,其次是激素响应元件,逆境响应元件最少.本研究可为研究调控香蕉蔗糖代谢的分子机制提供前期基础.

  • 相关文献

[1]香蕉NINV基因家族鉴定及分析. 吴建阳,陈妹,唐路平,胡会刚,武爱龙,张秀梅. 2024

[2]可可泛素结合酶基因家族的生物信息学初步分析. 赵秋芳,董晨,决登伟,陈宏良,贾利强. 2016

[3]巴西橡胶树RALF基因家族的鉴定及其表达分析. 杨洪,王立丰,代龙军,赵溪竹. 2021

[4]香蕉苯丙氨酸解氨酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 杨会晓,孙媛媛,贾彩红,金志强,徐碧玉,王卓. 2019

[5]香蕉α-淀粉酶基因家族的系统进化分析. 董晨,贾利强,决登伟,赵秋芳,陈宏良,胡会刚. 2016

[6]香蕉SPS基因家族的系统进化分析. 陈妹,吴建阳,张秀梅,邓旭,涂行浩,胡会刚,杜丽清. 2021

[7]香蕉β-淀粉酶基因家族的系统进化分析. 董晨,李伟才,魏永赞,王弋,郑雪文,胡会刚. 2016

[8]香蕉ACS基因家族的系统进化分析. 李伟才,张纯,魏永赞,王弋. 2017

[9]香蕉海藻糖-6-磷酸合成酶基因MaTPS2克隆及表达特性分析. 王安邦,吴琼,舒海燕,许桂莺,苗红霞,柯建浩,贾彩虹,邢文婷,许奕. 2016

[10]香蕉MYB转录因子基因的电子克隆及生物信息学分析. 谭琳,康由发,郑晓燕,黄丽娜,陈娇,马蔚红. 2015

[11]香蕉海藻糖合成酶基因(MaTPS5)生物学及表达特性分析. 邢文婷,李科明,贾彩红,舒海燕,王安邦,孙佩光,许桂莺. 2017

[12]香蕉MaERF-1基因的克隆、序列分析及表达载体构建. 金志强,徐碧玉,黄东梅,胡伟,李凯,许奕. 2017

[13]香蕉水通道蛋白SIP2-1基因的克隆和表达分析. 许奕,侯晓婉,徐碧玉,金志强,胡伟,宋顺. 2016

[14]香蕉MaSIP2-2基因的克隆、序列分析及表达载体构建. 许奕,金志强,徐碧玉,胡伟,黄东梅,宋顺. 2017

[15]香蕉MaTPS4基因序列及表达特性分析. 许桂莺,徐碧玉,邢文婷,孙威,王安邦,宋顺,陈青,李科明. 2016

[16]香蕉MaFLS1基因克隆、生物信息学分析及功能解析. 肖伟军,胡玉林,汪乔英,段雅婕,胡会刚. 2024

[17]香蕉MaTET基因的克隆与表达分析. 姜成东,刘菊华,徐碧玉,贾彩虹,苗红霞,金志强. 2015

[18]香蕉MaTPS3基因序列及表达特性分析. 许桂莺,李科明,舒海燕,王安邦,常胜和,孙威,宋顺,许奕,金志强. 2015

[19]香蕉多酚氧化酶基因编码序列的电子克隆和生物信息学分析. 谭琳,陈娇,李奕星,李芬芳,郑晓燕,郑丽丽,臧小平,袁德保. 2013

[20]香蕉MaTPS1基因序列及其表达特性分析. 许桂莺,徐碧玉,邢文婷,贾彩虹,王卓,常胜和,王安邦,舒海燕,金志强. 2015

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：中国热带农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台