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鸡热休克蛋白70基因克隆、单核苷酸多态性检测及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 晁哲 1 ; 林哲敏 1 ; 刘海隆 1 ; 张星 1 ; 郑心力 1 ; 黄丽丽 1 ; 谢亮 1 ; 王峰 1 ;

作者机构: 1.海南省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词: 鸡;热休克蛋白70基因;多态性;生物信息学分析

期刊名称: 中国畜牧兽医

ISSN: 1671-7236

年卷期: 2014 年 41 卷 03 期

页码: 194-199

收录情况: 北大核心

摘要: 试验旨在克隆鸡热休克蛋白70(heat shock protein 70,HSP70)基因,获得基因序列并分析基因结构和相关遗传变异,检测单核苷酸多态性(SNP)位点在文昌鸡和北京油鸡群体中的分布。试验利用PCR扩增鸡HSP70基因组序列,通过克隆测序寻找基因中的突变位点。在鸡HSP70基因组中共发现3处突变位点,分别位于启动子区(T-564C)、5′非翻译区(A-68G)和编码区(A-1044G)。使用PCR-RFLP方法检测T-564C位点后发现,等位基因C在文昌鸡和北京油鸡中的基因频率分别为0.87和0.55。利用生物信息学分析发现,鸡HSP70基因启动子区域存在一些潜在的转录因子结合位点,如Sp1、AP-1、GATA-1、CREB、MZF1和HSF2等。

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