文献类型： 中文期刊

作者： 谢攀攀 ¹ ; 徐铁山 ² ; 顾丽红 ³ ; 张丽 ¹ ;

作者机构： 1.广东海洋大学滨海农业学院

2.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

3.海南省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词： 嘉积鸭;APOC3基因;生长性状;单核苷酸多态性;关联分析

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2025 年 38 卷 004 期

页码： 855-864

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]筛查嘉积鸭载脂蛋白C3(APOC3)基因潜在的单核苷酸多态性(SNPs)位点,并分析其与生长性状的关联性,为嘉积鸭分子选育提供理论支撑.[方法]以嘉积鸭为研究对象,利用PCR扩增和直接测序法检测APOC3基因SNPs,并进行遗传多样性分析;采用SPSS对不同多态位点所对应的基因型与体尺指标进行相关性分析;利用HaploView软件分析APOC3基因SNPs的连锁不平衡和单倍型;通过NAfold WebServer软件预测不同基因型的mRNA二级结构.[结果]在嘉积鸭的APOC3基因中共发现11个SNPs,其中4个位于5'UTR,1个位于2号外显子中且为同义突变,其他6个为内含子突变,均存在3种基因型.其中,仅有3个SNPs 即 g.6555762G>A、g.6555842G>A、g.6555964C>T 符合 Hardy-Weinberg 平衡(P>0.05).SNPs 多态位点与体重体尺关联分析结果表明,具有显著关联(P<0.05)的是2个SNPs位点(g.6555465G>A、g.6555516G>A)与龙骨长,1个SNP位点(g.6555516G>A)与胫长,2 个 SNPs 位点(g.6555632C>T、g.6555640C>A)与体重,2 个 SNPs 位点(g.6555762G>A、g.6555842G>A)与胸深,1 个 SNPs 位点(g.6555842G>A)与体斜长,1 个 SNPs 位点(g.6555964C>T)与胫围.g.6555513C>T 和 g.6555516G>A存在强连锁关系,形成3种单倍型,即H1(CA)、H2(CG)、H3(TG).g.6555465G>A和g.6555494G>A位点的突变导致mRNA最小自由能升高,降低了 mRNA二级结构稳定性,其余3个位点的突变降低了最小自由能,增加了二级结构稳定性.[结论]嘉积鸭APOC3 基因的 7 个 SNPs(g.6555465G>A、g.6555516G>A、g.6555632C>T、g.6555640C>A、g.6555762G>A、g.6555964C>T、g.6555842G>A)对体重、体斜长等生长指标具有显著影响,可作为嘉积鸭选育的候选标记.