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含不同地区野生稻胞质的水稻雄性不育材料线粒体SSR标记分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孙炳蕊 1 ; 范芝兰 2 ; 李晨 2 ; 陈雨 1 ; 陈文丰 2 ;

作者机构： 1.广东省农业科学院水稻研究所

2.广东省农科院水稻研究所

关键词： 野生稻;胞质雄性不育;全基因组DNA;线粒体DNA;线粒体SSR;多样性分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2016 年 09 期

页码： 2392-2404

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 胞质雄性不育(CMS)基因的发现以及三系配套技术的成功使作物杂种优势得以广泛应用,目前不育胞质类型的单一在一定程度上限制了水稻杂种优势的利用。为了发掘新的不育胞质类型,本研究利用34个线粒体SSR标记对本课题组选育的19份胞质来源于不同地区普通野生稻的水稻CMS材料进行了遗传多样性分析,并以野败型的天丰A、红莲型的粤泰A、冈型的G46A和D型的D62A作为对照材料。结果显示,针对线粒体基因组,检测到的变异数范围1~5,Simpson多样性指数(Hi)范围0.15~0.58,平均遗传多样性指数0.079;在全基因组中检测到的等位变异数范围1~4,Simpson多样性指数(Hi)范围0.16~0.70,平均遗传多样性指数0.087。两种分析结果表现出较好的一致性:A37、A39和A3这三份不育材料分别在两个聚类结果中单独聚为一类,与其它不育材料(包括4份典型的不育系对照)遗传距离都较远,遗传差异最大,因此,推测这3份材料可能为新的不育胞质类型。同时,线粒体SSR标记R34可将这23份不育材料明显区分开来,对扩增片段测序对比发现R34扩增的片段与不育基因orf224有很高的同源性,因此,R34标记可作为鉴别胞质类型的分子标记。

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