文献类型： 中文期刊
作者： 张家莉 1 ; 令狐远凤 1 ; 段世宇 1 ; 潘永 2 ; 杨琦 1 ;
作者机构： 1.贵州大学动物科学学院
2.贵州省农业科学院畜牧兽医研究所
关键词： 鼠伤寒沙门菌;sRNA SdsR;TargetRNA2;靶基因;转录组测序
期刊名称： 福建农业学报
ISSN： 1008-0384
年卷期： 2022 年 004 期
页码： 439-444
收录情况： CSCD
摘要： 【目的】筛选鼠伤寒沙门菌sRNA SdsR的靶基因，为明确s RNA与靶基因的互作以及沙门菌的致病机制奠定基础。【方法】利用TargetRNA2软件预测sRNA SdsR的靶标，基于前期的s RNA SdsR敲除后转录组测序结果，将预测到的基因注释到GO、KEGG以及eggNOG数据库中进行分析，通过RT-qPCR对预测到的杂交能量较高的部分靶基因进行验证。【结果】TargetRNA2软件预测到29个靶标，其中hemA、STM0951、mreC、STM1 252、dcoC的杂交能量较高，且能与sRNA SdsR有连续的碱基匹配，分别与鼠伤寒沙门菌血红素合成、氧化还原过程、草酰乙酸脱羧酶的合成、膜的组成部分、细胞质蛋白的合成有关。RT-qPCR结果显示，相对于野生菌株3409，敲除s RNA SdsR后hemA、 mreC的表达分别下调0.70和0.39倍；STM0951、 STM1 252、 dcoC的表达分别上调0.51、 0.35和1.86倍。【结论】hemA、 STM0951、mreC、STM1252、dcoC基因很可能受s RNA SdsR的直接调控且对某些靶基因的表达有促进作用。
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