文献类型： 中文期刊

作者： 孙宇 ¹ ; 刘志鑫 ¹ ; 叶子 ¹ ; 罗睿雄 ¹ ; 蒲金基 ¹ ; 张贺 ¹ ;

作者机构： 1.海南大学植物保护学院;中国热带农业科学院环境与植物保护研究所/农业农村部热带作物有害生物综合治理重点实验室;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

关键词： 杧果;SAP转录因子;全基因组鉴定;表达分析

期刊名称： 山西农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1671-8151

年卷期： 2021 年 41 卷 003 期

页码： 79-87

收录情况： 北大核心

摘要： [目的]SAP转录因子是一类广泛存在于植物细胞中的多功能基因,探究杧果SAP转录因子家族的序列特征及其表达特性,可以为后续对杧果抗病研究和分子育种奠定基础.[方法]以杧果全基因组数据为基础,采用生物信息学的方法对杧果SAP家族转录因子进行序列分析,并通过qRT-PCR技术研究杧果胶孢炭疽菌和细菌性黑斑病菌侵染过程中杧果SAP家族转录因子的相对表达量.[结果]从杧果基因组中鉴定了3个SAP转录因子家族成员,命名为MiSAP1、MiSAP2和MiSAP3;MiSAP1为不稳定亲水酸性蛋白,MiSAP2为稳定亲水碱性蛋白,MiSAP3为不稳定亲水酸性蛋白;无规则卷曲和α-螺旋是3个MiSAPs蛋白二级结构的主要元件,除了MiSAP3以外,MiSAP1和MiSAP2均具有WD40超家族保守域结构;根据三级结构预测、多重序列比对、系统发育关系及保守基序分析推测MDP0000245114、Solyc07g045560.1.1、MiSAP3、MDP0000121314、MDP0000717044不存在WD40保守结构域,mo?tif4和motif5不是构成WD40保守结构域的主要结构,对于亲缘关系较近的蛋白质,推测它们还具有相似或相近的生物学功能.qRT-PCR结果显示,胶孢炭疽菌侵染过程中,MiSAP1和MiSAP2的相对表达量在12、24、48 h时均显著上调,MiSAP3的相对表达量在3 h和12 h时均显著上调,细菌性黑斑病菌侵染过程中,MiSAP1、MiSAP2和MiSAP3的相对表达量在12 h时均显著上调.[结论]本文通过qRT-PCR的方法初步确定了杧果SAP转录因子表达受胶孢炭疽菌和细菌性黑斑病菌的诱导,说明了SAP转录因子不仅能够影响花器官的大小,也参与生物胁迫响应效应.