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侵染红肉火龙果的蟹爪兰X病毒贵州分离物基因组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 郑乾明 1 ; 王小柯 1 ; 王壮 1 ; 马玉华 1 ;

作者机构： 1.贵州省农业科学院果树科学研究所

关键词： 复制酶;外壳蛋白;核苷酸;序列一致性

期刊名称： 植物病理学报

ISSN： 0412-0914

年卷期： 2019 年 02 期

页码： 219-225

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过高通量测序和RT-PCR扩增,克隆并分析蟹爪兰X病毒(Zygocactus virus X,ZyVX)贵州分离物ZyVX-GZ基因组序列。对表现病毒病症状的红肉火龙果植株进行高通量测序,获得4条ZyVX相关contig。RT-PCR扩增并拼接获得ZyVX-GZ基因组,全长为6 567 nt,5'-UTR和3'-UTR分别为60nt和70nt。含有5个ORF,分别编码复制酶蛋白、TGB1、TGB2、TGB3蛋白和外壳蛋白。ZyVX-GZ与P39和B1分离物基因组序列一致性均为91%。TGB1-3、外壳蛋白基因与大多数分离物核苷酸和推导的氨基酸序列一致性分别为95%～99%和96%～100%;复制酶基因的核苷酸和推导的氨基酸序列一致性分别为80%～89%和92%～97%。系统进化分析表明,ZyVX群体的遗传分化与寄主种类、地理分布不存在相关性。本研究结果丰富了ZyVX群体的基因组序列信息,为ZyVX的监测和防控提供了基础。

  • 相关文献

[1]利用高通量测序分析侵染贵州火龙果的病毒. 郑乾明,王壮,彭志军,马玉华,蔡永强. 2017

[2]侵染贵州火龙果的仙人掌X病毒基因组序列分离与变异分析. 郑乾明,柏自琴,王小柯,林乾,王彬,马玉华. 2022

[3]侵染贵州火龙果的蟹爪兰X病毒和火龙果X病毒基因组序列差异和遗传变异. 郑乾明,王小柯,马玉华. 2022

[4]马铃薯X病毒外壳蛋白基因的克隆与系统进化分析. 黄永会,朱英,刘永翔. 2014

[5]贵州烟草花叶病毒株系初探. 王莉爽,吴石平,杨学辉,何海永,陈小均,袁洁. 2012

[6]抗马铃薯Y病毒的ihpRNA高效茎长度的选择. 刘新建,陶刚,刘永翔,朱英,邱礽,李奇科,刘作易. 2011

[7]侵染贵州火龙果的仙人指X病毒的基因组序列变异. 郑乾明,王小柯,马玉华. 2020

[8]马铃薯X病毒外壳蛋白基因片段的瞬时表达诱导对PVX的高抗性(英文). 黄永会,陶刚,朱英,Mariena Ketudat-Cairns,邱礽,刘永翔,刘作易. 2011

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