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陆地棉EPSPS基因全基因组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 巩元勇 1 ; 徐珍珍 1 ; 郭书巧 1 ; 束红梅 1 ; 蒋璐 1 ; 倪万潮 1 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院农业部长江下游棉花和油菜重点实验室

关键词： 陆地棉;陆地棉基因组;EPSPS基因

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2016 年 31 卷 01 期

页码： 15-21

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 当前在NCBI中提交的来源于陆地棉的EPSPS基因有2个,随着陆地棉基因组测序结果的公布,为在陆地棉基因组中全面鉴定EPSPS基因的存在提供了便利条件。从陆地棉异源四倍体标准系TM-1基因组数据库中共搜寻获得4个EPSPS同源基因,这4个基因分别分布在A07、A12、D07和D12亚基因组。从这4个基因的核苷酸序列、氨基酸序列和基因结构的比对,构建进化树的系统发育分析以及基因的转录情况研究来看,定位在A07和D07亚基因组的2个基因属于共线性高度同源基因,定位在A12和D12亚基因组的2个基因也是相同的情况。序列比对结果表明,已经在NCBI中提交的2个EPSPS基因分别是定位在A12和D12亚基因组上的基因,研究结果为定位在A07和D07亚基因组上EPSPS基因的克隆和功能研究提供了基础理论依据。

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[2]陆地棉GhZIP基因家族全基因组分析. 倪万潮,巩元勇,徐珍珍,郭书巧,束红梅,蒋璐. 2015

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