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应用高分辨率熔解曲线技术分析水稻分子标记基因型

文献类型： 中文期刊

作者： 赵均良 1 ; 张少红 1 ; 刘斌 1 ;

作者机构： 1.广东省农业科学院水稻研究所

关键词： 水稻;SSR标记;InDel标记;SNP标记;高分辨率熔解曲线

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2011 年 44 卷 18 期

页码： 3701-3708

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】验证高分辨熔解曲线(high-resolution melting curve analysis,HRM)技术在水稻分子标记分析中应用的可行性和可靠性,应用该技术对水稻重组自交系(RIL)群体及其亲本进行SSR、InDel和SNP标记基因型分析。【方法】以粳稻品种丽江新团黑谷(LTH)和籼稻品种三黄占2号(SHZ-2)及其衍生的RIL群体为材料,以纯合亲本LTH作为参比基因型,利用HRM技术分析一个G/A转换的SNP标记以及非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)难以分辨的一个SSR标记和一个InDel标记的基因型。【结果】通过加入适量的参比DNA,HRM能够分辨2个纯合亲本及其衍生的纯合体和杂合体RI系的分子标记基因型,并且以加入20%模板量的参比DNA对3种基因型的分辨最好。利用该方法对作图群体的部分RI系进行分子标记基因型分析,结果与变性PAGE的分析结果完全吻合。【结论】验证了HRM应用于水稻SSR、InDel以及SNP标记分析的可行性和可靠性。相对于凝胶电泳分析,HRM具有分辨率高、高效、快速、操作简单、安全等优点,是一种在水稻分子标记分析中很有应用前景的技术。

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