您好,欢迎访问中国水产科学研究院 机构知识库!

美丽硬仆骨舌鱼mtDNA D-loop区遗传变异特征

文献类型: 中文期刊

作者: 牟希东 1 ; 宋红梅 1 ; 汪学杰 1 ; 杨叶欣 1 ; 罗渡 1 ; 顾党恩 1 ; 罗建仁 1 ; 胡隐昌 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室

关键词: 美丽硬仆骨舌鱼;mtDNA;D-loop;遗传变异

期刊名称: 生物技术通报

ISSN: 1002-5464

年卷期: 2012 年 0 卷 09 期

页码: 185-190

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用直接测序法分析美丽硬仆骨舌鱼(Scleropages formosus)3个种群(金龙鱼、红龙鱼和青龙鱼)共24个个体的线粒体D-loop区的遗传变异特征。经序列比对、分析,金龙鱼、红龙鱼和青龙鱼的D-loop序列不仅在个体间存在位点序列的变异(17个简约性信息位点),而且还存在序列长度的多态性(长度为915-924 bp),这种长度的差异在于存在不同碱基长度的微卫星序列。3种龙鱼碱基组成基本一致,G含量偏低。定义了10种单倍型,但金龙鱼、红龙鱼和青龙鱼间没有共享单倍型,单倍型多样度较高(0.667-1.00),核苷酸多样度较低(0.001 09-0.003 23)。AMOVA分析显示,变异主要来自地理区内不同群体间,个体间遗传距离为0-0.008 7,显示遗传变异仍处于种内水平。NJ、MP和Bayesian构建的分子系统树拓扑结构基本一致,但不能有效地反映金龙鱼、红龙鱼和青龙鱼间的亲缘关系。

  • 相关文献

[1]不同体色锦鲤和"福瑞鲤2号"mtDNA D-loop序列遗传变异分析. 李潇轩,郑端端,罗明坤,杨志强,郭珺,王兰梅,董在杰. 2023

[2]珠江和长江水系赤眼鳟D-loop基因序列遗传变异分析. 杨慧荣,赵会宏,刘丽,陈彦珍,林权卓,黄宏辉. 2012

[3]美丽硬仆骨舌鱼Raf激酶基因的克隆、组织表达及原核表达分析. 刘奕,杨叶欣,刘超,宋红梅,汪学杰,牟希东. 2021

[4]基于线粒体细胞色素b基因序列的骨舌鱼科鱼类分子系统发育的研究. 牟希东,王培欣,胡隐昌,汪学杰,宋红梅,李小慧,罗建仁. 2010

[5]美丽硬仆骨舌鱼全基因组微卫星分布规律特征. 段永楠,刘奕,胡隐昌,刘超,宋红梅,汪学杰,孙金辉,牟希东. 2019

[6]美丽硬仆骨舌鱼核型分析. 田媛,牟希东,汪学杰,顾党恩,胡隐昌,罗建仁. 2013

[7]应用微卫星多态分析美丽硬仆骨舌鱼三个品系遗传结构. 牟希东,胡隐昌,李小慧,汪学杰,宋红梅,罗建仁. 2010

[8]Genetic variation among four bred populations of two tilapia strains, based on mitochondrial D-loop sequences. Zou, Zhiying,Li, Dayu,Zhu, Jinglin,Han, Jue,Xiao, Wei,Yang, Hong. 2015

[9]Phylogeny and Evolution of Multiple Common Carp (Cyprinus carpio L.) Populations Clarified by Phylogenetic Analysis Based on Complete Mitochondrial Genomes. Dong, Chuanju,Xu, Jian,Wang, Baosen,Sun, Xiaowen,Xu, Peng,Dong, Chuanju,Xu, Jian,Wang, Baosen,Sun, Xiaowen,Xu, Peng,Dong, Chuanju,Feng, Jianxin,Jeney, Zsigmond.

[10]Mitochondrial genome of the tomato clownfish Amphiprion frenatus (Pomacentridae, Amphiprioninae). Ye, Le,Hu, Jing,Wu, Kaichang,Wang, Yu,Ye, Le,Wu, Kaichang,Wang, Yu,Li, Jianlong.

[11]长江流域4个野生大眼鳜群体的遗传多样性分析. 程起群,吕浩,逄娇慧,赵金良. 2019

[12]长江流域4个野生大眼鳜群体的遗传多样性分析. 程起群,吕浩,逄娇慧,赵金良. 2019

[13]中国达氏鳇野生群体和两个养殖群体的线粒体遗传多样性分析. 户国,程磊,马波,孙大江,王斌,刘晓勇,柳淑芳,张颖. 2018

[14]基于多个线粒体序列的中韩俄沿海不同地理群体刺参的遗传多样性及种群结构分析. 王锦锦,廖梅杰,李彬,王印庚,荣小军,张正,葛建龙. 2020

[15]基于Cytb与D-loop的罗非鱼选育群体遗传结构对比分析. 颉晓勇,钟金香,李思发. 2014

[16]结合线粒体D-loop序列和SSR标记对宝石鲈养殖群体遗传多样性的分析. 赵立祥,董浚键,孙成飞,田园园,胡婕,卢迈新,叶星. 2019

[17]用线粒体DNA D-loop区序列探讨盘丽鱼属鱼类系统分类. 张静,白俊杰,叶星,劳海华,简清,罗建仁. 2006

[18]罗非鱼选育群体Cytb与D-loop序列变异信息对比分析. 颉晓勇,李思发. 2014

[19]3个水域黄鳍鲷线粒体DNA D-loop基因序列多态性研究. 刘红艳,江世贵,苏天凤,龚世园. 2004

[20]基于线粒体控制区的中国近海棘头梅童鱼群体遗传结构研究. 梁述章,宋炜,马春艳,蒋科技,张凤英,赵明,马凌波. 2019

作者其他论文 更多>>