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黄瓜抗黑星病相关基因的差异表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李全辉 1 ; 李锡香 1 ; 王海平 1 ; 邱杨 1 ; 宋江萍 1 ; 张晓辉 1 ; 沈镝 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院蔬菜花卉研究所

关键词： 黄瓜;黑星病;抑制性消减杂交;差异表达

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2013 年 14 卷 03 期

页码： 501-506+517

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以抗黑星病黄瓜材料HX1为试材,接种黑星病菌(Cladosporium cucumerinum)2 h、8 h、20 h、32 h和72 h的叶片作为试验方(Tester),相应的未接种叶片作为对照方(Driver),利用SSH技术,构建了黑星病菌侵染初期的正向和反向cDNA-SSH文库。用巢式引物PCR检测插入片段,获得了200个阳性克隆,通过测序,除去重复序列,共得到105个Unique ESTs,其中50个为singleton,55个为contings。与非冗余蛋白数据库进行BLASTx比对,结果显示,17条ESTs未找到同源序列,88条非重复序列和已知基因的同源性较高,占全部ESTs序列的83.8%,其中86条ESTs与非冗余蛋白数据库已知功能的蛋白具有高度的相似性。结合高密度点阵膜杂交差异筛选,阳性率为75.0%。经初步分析这些序列的功能,差异表达的ESTs功能涉及能量和基础代谢、信号转导、蛋白和核酸代谢、光合作用及逆境中特异表达的基因等方面,为研究黄瓜抗黑星病基因提供了依据。

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