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陆地棉NF-YB基因家族的全基因组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘静 1 ; 徐珍珍 1 ; 袁娜 1 ; 郭月 1 ; 张保龙 1 ; 杜建厂 1 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院

关键词： NF-YB基因家族;陆地棉;生物信息

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2016 年 31 卷 05 期

页码： 21-27

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了进一步了解NF-YB基因家族结构的功能,利用生物信息学手段,系统研究了陆地棉标准系TM-1基因组中NF-YB基因家族的数目、亚细胞定位、染色体分布、进化关系、基序以及组织表达情况。结果表明:TM-1基因组中共有41个NF-YB基因家族成员,它们含有相同的CBFD_NFYB_HMF结构域,大部分定位到细胞核内;41个NF-YB基因家族成员分布在19条染色体上,其中有19组成员在A亚组和D亚组中表现为直系同源基因;进化树分为Ⅰ和Ⅱ2个小组,每个小组成员间具有相似的基序类型和排列顺序;组织表达分析则发现,在这41个NF-YB基因家族成员中,至少有24个成员可以进行表达,且表现出一定的组织特异性。

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