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南京萝卜黄瓜花叶病毒和芜菁花叶病毒的检测及序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 邓智亭 1 ; 王满 2 ; 席敏敏 1 ; 季英华 2 ; 徐秋芳 2 ; 王长春 3 ;

作者机构: 1.浙江师范大学生命科学学院

2.江苏省农业科学院植物保护研究所

3.浙江师范大学化学与生命科学学院

关键词: 萝卜;黄瓜花叶病毒;芜菁花叶病毒;病毒检测;序列分析

期刊名称: 浙江师范大学学报(自然科学版)

ISSN: 1001-5051

年卷期: 2024 年 47 卷 004 期

页码: 437-445

摘要: 为明确呈现褪绿和花叶症状的南京萝卜的具体病原,应用反转录PCR法对采集的萝卜病样进行了14种病毒的检测及序列分析.结果表明:南京萝卜病样感染了黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus, CMV)和芜菁花叶病毒(turnip mosaic virus, TuMV),进一步对该萝卜样品中扩增到的CMV外壳蛋白基因(coat protein,CP)序列分析发现,CMV CP基因序列与已公开的苦瓜、烟草和茄子等分离物的CP序列高度同源,序列相似性高达98%,系统进化树表明CMV CP序列属于ⅠB亚组;该萝卜病样的TuMV CP序列与来自韩国、朝鲜及日本等国家的TuMV分离物CP序列同源性最高,相似性达99.65%;系统进化树表明,TuMV CP序列属于TuMV的Basal-BR亚组.研究结果鉴定了南京地区萝卜病样感染的病毒种类,通过CP基因序列分析明确了感染南京萝卜的CMV与TuMV与其他分离物之间的亲缘关系,为制定相应的防控措施提供了理论基础.

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