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白菜型油菜IGT基因家族的鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 裴大妹 1 ; 王龙 1 ; 马茜茹 1 ; 李华欣 1 ; 肖麓 1 ;

作者机构： 1.青海省农林科学院

关键词： 白菜型油菜;IGT基因;分枝角度;进化分析;理想株型;生物信息学;转录组

期刊名称： 草业科学

ISSN： 1001-0629

年卷期： 2024 年 004 期

页码： 873-883

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： IGT是调控植物分枝角度的关键基因家族，且对植物的产量、生物量以及观赏效果都有着重要作用。本研究基于白菜型油菜（Brassica rapa）、拟南芥（Arabidopsis thaliana）等基因组序列信息，在全基因组水平上，对IGT基因家族进行理化性质分析、染色体定位、亚细胞定位预测、进化关系、顺式元件预测、共线性及表达模式分析。结果表明，在白菜型油菜中共鉴定到11个IGT基因；系统进化关系将其分为7个分枝，每个分枝均由相似的保守基序组成；染色体定位和共线性分析表明，在杂交和多倍化的过程中，该家族成员的染色体并未发生明显的变化，且片段复制和同源拷贝可能是其扩张的主要方式。在多数IGT启动子中发现光响应元件占主导地位，脱落酸、茉莉酸甲酯响应元件次之，表明IGT启动子可能为诱导型启动子。转录组分析发现，白菜型油菜的IGT基因在不同组织（愈伤组织、花、叶、根、角果、茎）中有着不同的表达模式，尤其是TAC1基因（BraIGT-11）在花中有着较高的表达水平，叶和茎则次之，表明TAC1在调控分枝角度和花发育等方面可能发挥着重要的功能。综上所述，本研究为后续BraIGT基因功能的研究提供了理论依据，同时也为白菜型油菜理想株型的选育以及分子育种提供了参考。

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