文献类型: 中文期刊
作者: 张高伟 1 ; 吴彪 1 ; 刘志鸿 1 ; 周丽青 1 ; 孙秀俊 1 ; 赵庆 1 ; 杨爱国 1 ;
作者机构: 1.农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所;上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心;青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室
关键词: 魁蚶;HIF-1α;基因特征;低氧胁迫;响应规律
期刊名称: 中国水产科学
ISSN: 1005-8737
年卷期: 2019 年 04 期
页码: 646-656
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 低氧诱导因子(hypoxia-induciblefactor,HIF)是低氧信号传导途径中的关键因子,在动物低氧应答反应中发挥重要作用。为探讨魁蚶(Scapharca broughtonii) HIF-1α基因结构特征及在低氧胁迫下的应答规律,本研究以魁蚶转录组数据库中的部分序列为基础,通过cDNA末端快速扩增(rapid amplication of cDNA ends, RACE)技术克隆获得了魁蚶HIF-1α基因cDNA全长序列(命名为SbHIF-1α),并检测了其mRNA的组织分布和低氧胁迫下的表达规律。序列和结构分析显示, SbHIF-1α基因cDNA全长为2741 bp,其中包括2136 bp的ORF,编码711个氨基酸,含有HIF保守的HLH、PAS-A、PAS-B和PAC结构域,预测蛋白分子量为80.8kDa,理论等电点为5.57;SbHIF-1α与所选其他物种HIF-1α的序列相似度为56%~95%;系统进化分析显示SbHIF-1α与软体动物的遗传距离最近。qRT-PCR结果显示,在魁蚶的血淋巴、鳃、外套膜、斧足、闭壳肌和肝胰腺6个组织内均能检测到SbHIF-1α基因,在血淋巴中表达量最高,鳃次之,与其他4个组织都存在显著差异(P<0.05)。海水溶解氧(DO)为0.5 mg/L、2.5 mg/L、4.5mg/L的低氧胁迫下,每个组织中SbHIF-1α都积极响应,其中血淋巴和鳃比其他四个组织的响应程度大;血淋巴中, DO为0.5 mg/L胁迫4 h后, SbHIF-1α的表达量较对照组即达到极显著差异(P<0.01),胁迫64 h后,表达量达到最高,是对照组的519.43倍;每个组织对不同浓度DO处理响应结果表明,3个处理浓度中0.5mg/L处理对SbHIF-1α激活程度相对较大。本研究明确了SbHIF-1α的基因结构特征、时空表达特征及对低氧胁迫的响应规律,丰富了海洋贝类HIF基因的研究资料。
- 相关文献
[1]低氧预适应对魁蚶在低氧胁迫下生理生化指标的影响. 吴丽娜,吴彪,刘志鸿,于涛,孙秀俊,周丽青,郑言鑫,王振原. 2023
[2]奥利亚罗非鱼、尼罗罗非鱼MyoD1和MyoD2基因特征及差异. 卢中华,俞菊华,李红霞,李建林,唐永凯,阮瑞霞,杨光. 2010
[3]拟腹吸鳅属鱼类线粒体基因组特征与系统发育分析. 宋小晶,凌建忠. 2024
[4]合浦珠母贝含硒谷胱甘肽过氧化物酶基因特征与表达分析. 姜晶晶,张殿昌,麻建军,苏天凤,江世贵. 2010
[5]急性和慢性低氧胁迫条件下卵形鲳鲹幼鱼肝脏的组织损伤及抗氧化酶活性变化. 陈世喜,王鹏飞,区又君,温久福,李加儿,王雯,谢木娇. 2015
[6]卵形鲳鲹低氧相关基因的克隆、序列分析及其在低氧胁迫下的表达变化. 陈世喜,区又君,王鹏飞,李加儿,温久福,王雯. 2016
[7]魁蚶4个地理群体ITS序列变异及系统发生分析. 周丽青,杨爱国,王清印,吴彪,于涛. 2012
[8]魁蚶两个不同群体形态性状对体质量的影响效果分析. 吴彪,杨爱国,刘志鸿,周丽青,邱梅,辛梅,李靖. 2010
[9]急性病毒性坏死病毒魁蚶株IAP-86基因全长cDNA克隆和生物信息学分析. 张帅,王崇明,岳志芹,宋晓玲,白昌明,尹伟力,黄倢. 2015
[10]魁蚶4个地理群体遗传结构的RAPD分析. 梁超,杨爱国,刘志鸿,周丽青,吴彪. 2010
[11]筏式和底播增养殖模式下魁蚶食物来源的比较研究. 蔡星媛,张秀梅,刘旭绪,尤凯,张沛东. 2016
[12]基于SSR标记的魁蚶(Scapharca broughtonii)不同群体遗传结构的分析. 吴彪,梁超,杨爱国,周丽青,刘志鸿. 2012
[13]牡蛎疱疹病毒对魁蚶的致病性. 汪清晨,白昌明,张天文,王崇明,邱兆星,黄健. 2016
[14]魁蚶中国群体与韩国群体杂交子一代养成期生长比较. 郑言鑫,蔡忠强,王鹏,吴彪,张树宝,赵春暖,于涛,林建国,孙超. 2018
[15]魁蚶(Scapharca broughtonii)半乳糖凝集素(SbGal)基因cDNA的克隆及表达分析. 郑利兵,吴彪,刘志鸿,周丽青,孙秀俊,田吉腾,杨爱国,郑言鑫. 2015
[16]青岛灵山湾筏式养殖魁蚶食物来源的季节变动研究. 蔡星媛,张秀梅,刘甜雨,李文涛,张沛东. 2016
[17]魁蚶Ets家族9个基因的克隆及其在病毒感染应答中的表达分析. 魏智薪,辛鲁生,白昌明,李亚楠,张淑敏,李成华,王崇明. 2019
[18]魁蚶(Scapharca broughtonii)热休克蛋白90(HSP90)基因的克隆及转录表达分析. 郑利兵,刘志鸿,吴彪,周丽青,孙秀俊,杨爱国,田吉腾,董迎辉. 2018
[19]温度对魁蚶能量代谢及抗氧化酶活性的影响. 薛素燕,王金叶,李加琦,丁敬坤,李阳,徐涵,毛玉泽,方建光. 2019
[20]魁蚶(Scapharca broughtonii)不同地理群体的遗传多样性及种群结构. 刘寒苗,吴彪,刘志鸿,杨爱国,周丽青,孙秀俊. 2017
作者其他论文 更多>>
-
青岛典型潮间带贝类的种类组成与群落特征
作者:原大山;刘志鸿;马培振;孙秀俊;周丽青;李转转;徐东;吴彪
关键词:潮间带;底质;群落结构;多样性;优势种
-
圆斑星鲽雌性特异DNA分子标记开发及遗传性别鉴定方法的建立
作者:郑卫卫;徐文腾;刘洋;陈亚东;杨涛;席晓晴;刘志鸿;徐东;秦搏;陈松林
关键词:圆斑星鲽;雌性特异DNA分子标记;遗传性别鉴定;基因组重测序
-
盐度对近江牡蛎生理及相关基因表达的影响
作者:杨苗苗;夏苏东;刘志鸿;孙秀俊;周丽青;马培振;李转转;吴彪
关键词:近江牡蛎;盐度;生理变化;基因表达
-
单环刺螠体腔液对不同病原菌暴露的免疫应答分析
作者:王思婕;许星鸿;迟嘉乐;孙秀俊;李百玉;席晨宵;杨笑
关键词:单环刺螠;病原菌;免疫;抗氧化;基因表达
-
我国水产种质资源利用安全战略研究
作者:王娜;邵长伟;刘志鸿;张晓雯;廖梅杰;高保全;吴彪;孙秀俊;陈张帆;刘宇岩;陈松林
关键词:水产种质资源;利用安全;基因组资源共享平台;经济性状遗传机制解析;知识产权保护
-
涠洲岛石蚝闭壳肌营养成分分析与品质评价
作者:马培振;陈默;梁彬兰;周于娜;李鹏飞;李翔伦;吴彪
关键词:舌骨牡蛎;闭壳肌;氨基酸;脂肪酸;品质评价
-
菲律宾蛤仔幼虫DNA的高效提取及在遗传分析中的应用
作者:张磊;许星鸿;刘志鸿;吴彪;周丽青;李转转;马培振;孙秀俊
关键词:基因组DNA;D形幼虫;遗传分析;COX1;16SrRNA;菲律宾蛤仔




