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水芹OjHSP90基因克隆及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 胡艳平 1 ; 李德明 1 ; 朱白婢 1 ; 黄文枫 1 ; 周曼 1 ; 蔡兴来 1 ; 王敏 1 ;

作者机构: 1.海南省农业科学院蔬菜研究所海南省瓜菜育种工程技术研究中心

关键词: 基因克隆;生物信息学分析;OjHSP90;水芹

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2016 年 14 卷 11 期

页码: 2959-2963

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究从水芹中克隆得到一个HSP基因Oj HSP90,生物信息学分析表明:水芹Oj HSP90基因全长2 100 bp,编码699个氨基酸;Oj HSP90蛋白的理论分子量为80.3 k D,等电点为5.01,是一种亲水性的稳定蛋白;Oj HSP90蛋白的二级结构中,α-螺旋占52.93%,延伸链占16.74%,β-折叠占5.87%,无规则卷曲占24.46%;该蛋白的N端含有1个HSP90超家族蛋白保守的结构域YSNKEIFLRE,能够与ATP结合;进化树分析表明,Oj HSP90蛋白与拟南芥At HSP90蛋白和烟草Nt HSP90的相似度最高,分别为91.99%和92.13%。本研究旨在为进一步研究HSP90基因的功能以及研究水芹耐高温途径提供理论参考。

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